154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0639 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0639  exonuclease  100 
 
 		 215 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  44.61 
 
 		 1454 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  44.16 
 
 		 1485 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.31 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  45.74 
 
 		 1476 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  40.09 
 
 		 1510 aa  158  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2298  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.71 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6834  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.68 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000544485  normal  0.0136753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3681  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.54 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1721  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.02 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  hitchhiker  0.0000758333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1552  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.5 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0259008  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2722  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.9 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.39 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.929727  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0139  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.92 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0192788 
 
 
-
 
NC_002950  PG0172  exonuclease  29.19 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0640  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.11 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.893813  normal  0.641508 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.192375  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.51 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1161  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.32 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1764  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.9 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.387329  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0011  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.16 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.536124  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.89 
 
 		 1433 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  30.23 
 
 		 1468 aa  58.2  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  25.99 
 
 		 313 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.32 
 
 		 565 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  36.75 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  28.27 
 
 		 1635 aa  56.2  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.69 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2759  DNA polymerase III subunit epsilon  29.73 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.137424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1509  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.2 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  28.33 
 
 		 1464 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.67 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  30.27 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  29.19 
 
 		 1365 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.19 
 
 		 722 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.58 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.98 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.52 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0436  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.54 
 
 		 339 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0464133  normal  0.956681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.7 
 
 		 498 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.91 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0626  exonuclease, putative  24.88 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0689924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.33 
 
 		 328 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.91 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  33.62 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0588  putative exonuclease  25.23 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  33.62 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08720  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  27.13 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  31.3 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.67 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.46 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0251  exonuclease  29.12 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  26.43 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 		 719 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  28 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  27.13 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.84 
 
 		 367 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.75 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5735  DNA polymerase III subunit epsilon  31.3 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2481  DNA polymerase III subunit epsilon  30.17 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000473559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 		 253 aa  48.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1920  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  28.22 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.931749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  28.57 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0426  helicase, UvrD/REP/exonuclease family protein  27.68 
 
 		 870 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  31.97 
 
 		 719 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  29.37 
 
 		 1444 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  24.29 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.32 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  25.62 
 
 		 584 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.5 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.865455  normal  0.183971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  29.26 
 
 		 578 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1647  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  28.7 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000174997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15120  DNA polymerase III subunit epsilon  23.32 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0314  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.124129 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  25.41 
 
 		 1443 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1638  DNA polymerase III, epsilon subunit, putative  27.61 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.400233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.36 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  26.15 
 
 		 1440 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  32.2 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2137  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.93 
 
 		 864 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.14 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.64 
 
 		 706 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4160  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.89 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0016  DNA-directed DNA polymerase  28.89 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0421  helicase/exonuclease  26.55 
 
 		 870 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.28 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0688  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.21 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.219348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.25 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 714 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  27.35 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  27.35 
 
 		 246 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  31.09 
 
 		 299 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  26.7 
 
 		 485 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.32 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187406  hitchhiker  0.0000370659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  27.14 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.21 
 
 		 238 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 729 aa  45.1  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2355  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.32 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.91 
 
 		 204 aa  45.1  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2344  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.32 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>