22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6834 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6834  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 193 aa  406  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000544485  normal  0.0136753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.22 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  37.7 
 
 		 1454 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  37.31 
 
 		 1485 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  37.76 
 
 		 1476 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0639  exonuclease  35.68 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  37.37 
 
 		 1510 aa  118  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2298  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.26 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2722  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.78 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3681  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1721  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.02 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  hitchhiker  0.0000758333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1552  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.05 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0259008  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.14 
 
 		 442 aa  51.6  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  26.44 
 
 		 345 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  28.74 
 
 		 457 aa  46.2  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.99 
 
 		 453 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 		 769 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.88 
 
 		 721 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  24 
 
 		 715 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  35.71 
 
 		 630 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  27.17 
 
 		 516 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>