31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1552 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1552  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0259008  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.2 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  32.81 
 
 		 1476 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0639  exonuclease  32.5 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1721  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.88 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  hitchhiker  0.0000758333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  29.84 
 
 		 1454 aa  88.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3681  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.69 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  30.89 
 
 		 1510 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  30.57 
 
 		 1485 aa  80.1  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2298  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.29 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2722  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.73 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.43 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.84 
 
 		 406 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6834  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.05 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000544485  normal  0.0136753 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0011  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.88 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.536124  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.81 
 
 		 410 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1509  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.63 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1161  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.48 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  26.56 
 
 		 578 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28650  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  28.24 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.50801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0640  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.46 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.893813  normal  0.641508 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2362  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.42 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2481  DNA polymerase III subunit epsilon  23.62 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000473559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  28.07 
 
 		 530 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1948  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.36 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1982  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.36 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15120  DNA polymerase III subunit epsilon  27.03 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  29.32 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3499  exonuclease  27.08 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108148  hitchhiker  4.31103e-25 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0183  DNA polymerase III subunit epsilon  25.73 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>