229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0011 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0011  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
189 aa  393  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.536124  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1161  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  95.77 
 
 
189 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0139  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.03 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0192788 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.6 
 
 
189 aa  171  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.929727  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  46.49 
 
 
191 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.192375  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1764  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.41 
 
 
191 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.387329  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1920  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  42.11 
 
 
204 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.931749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1638  DNA polymerase III, epsilon subunit, putative  41.58 
 
 
204 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.400233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.94 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.2 
 
 
410 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  39.81 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  39.81 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  39.81 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  36.45 
 
 
238 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  34 
 
 
244 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.96 
 
 
231 aa  62  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  39.81 
 
 
244 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.86 
 
 
235 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.35 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.31 
 
 
378 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0639  exonuclease  28.16 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  32.67 
 
 
244 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  32.67 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.5 
 
 
502 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.88 
 
 
234 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.45 
 
 
398 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.41 
 
 
230 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.96 
 
 
237 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.31 
 
 
375 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.31 
 
 
375 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.7 
 
 
459 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.04 
 
 
237 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2298  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.18 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 
375 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  34.26 
 
 
229 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
241 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.17 
 
 
462 aa  55.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 
240 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 
375 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 
375 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  31.78 
 
 
345 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.26 
 
 
229 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.92 
 
 
238 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
244 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  25.42 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  31 
 
 
333 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
240 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
240 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 
228 aa  55.1  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
249 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.13 
 
 
225 aa  55.1  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.97 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.71 
 
 
231 aa  54.7  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.86 
 
 
453 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.97 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.57 
 
 
466 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.13 
 
 
406 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  31.97 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 
330 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.22 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.24 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  25.86 
 
 
379 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.58 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  31.34 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.46 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 
330 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.02 
 
 
238 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 
330 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1296  DNA polymerase III subunit epsilon  37.84 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
244 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  32.76 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  30.17 
 
 
329 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1361  DNA polymerase III subunit epsilon  37.84 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  23.73 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.98 
 
 
234 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.7 
 
 
463 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.4 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.45 
 
 
456 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3006  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  33.93 
 
 
381 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00547496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2940  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  33.93 
 
 
381 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3040  DNA polymerase/helicase  33.93 
 
 
381 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  31.48 
 
 
242 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  31.48 
 
 
242 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  26.72 
 
 
530 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.66 
 
 
243 aa  51.6  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.95 
 
 
235 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.35 
 
 
235 aa  51.2  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  26.73 
 
 
228 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.86 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  26.23 
 
 
407 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.71 
 
 
241 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.71 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.94 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1552  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.88 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0259008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>