239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1161 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1161  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
189 aa  393  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0011  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  95.77 
 
 
189 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.536124  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.6 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.929727  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0139  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.03 
 
 
190 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0192788 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  46.49 
 
 
191 aa  168  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.192375  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1764  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.41 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.387329  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1920  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  42.11 
 
 
204 aa  147  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.931749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1638  DNA polymerase III, epsilon subunit, putative  41.58 
 
 
204 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.400233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.43 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.16 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  38.89 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  38.89 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  38.89 
 
 
244 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  38.89 
 
 
244 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  32.67 
 
 
244 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.96 
 
 
231 aa  61.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.78 
 
 
235 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0639  exonuclease  27.32 
 
 
215 aa  60.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  36.45 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.45 
 
 
378 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  32.67 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  32.67 
 
 
244 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  31.13 
 
 
330 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  31.13 
 
 
330 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  32.71 
 
 
345 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  31.13 
 
 
330 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.62 
 
 
234 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  25.64 
 
 
170 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 
398 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
241 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.45 
 
 
375 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.45 
 
 
375 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.91 
 
 
406 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0978  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 
280 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0235504  normal  0.0652516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  32 
 
 
333 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 
243 aa  55.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.72 
 
 
375 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.72 
 
 
375 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.72 
 
 
375 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.71 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
240 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.7 
 
 
459 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.68 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.68 
 
 
230 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
240 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  36.11 
 
 
253 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.11 
 
 
237 aa  55.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.94 
 
 
230 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  31.09 
 
 
329 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  35.19 
 
 
249 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2298  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.18 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  35.19 
 
 
244 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  25.64 
 
 
379 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  27.59 
 
 
530 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.22 
 
 
224 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  34.26 
 
 
229 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.7 
 
 
462 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  32.76 
 
 
242 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.26 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  24.37 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.14 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.04 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.71 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  22.4 
 
 
389 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  27.72 
 
 
228 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 
453 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.72 
 
 
530 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.22 
 
 
240 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.14 
 
 
482 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  34.26 
 
 
244 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.46 
 
 
231 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  30.6 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.85 
 
 
328 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.57 
 
 
466 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.15 
 
 
235 aa  51.2  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.93 
 
 
502 aa  51.2  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  25.5 
 
 
242 aa  51.2  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  30.61 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.61 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0400  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.71 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0564  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.71 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.7 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.4 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.02 
 
 
238 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.55 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1296  DNA polymerase III subunit epsilon  37.27 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.98 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.95 
 
 
463 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.35 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 
476 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.98 
 
 
253 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1361  DNA polymerase III subunit epsilon  37.27 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.04 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3006  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  36 
 
 
381 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00547496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3040  DNA polymerase/helicase  36 
 
 
381 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.01 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>