283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0139 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0139  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0192788 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1764  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  94.74 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.387329  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  95.26 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.192375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  77.78 
 
 		 189 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.929727  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0011  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.03 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.536124  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1161  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  47.03 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1920  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  43.78 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.931749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1638  DNA polymerase III, epsilon subunit, putative  43.24 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.400233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.52 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0639  exonuclease  27.92 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.98 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  40 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.62 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.03 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  31.36 
 
 		 345 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.38 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  39.05 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.17 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.58 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.9 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  29.06 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  29.06 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  33.03 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.93 
 
 		 769 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.55 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  29.06 
 
 		 330 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.48 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.03 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  29.82 
 
 		 1454 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.21 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.54 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  36.21 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.55 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.14 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9062  DNA-directed DNA polymerase  26.98 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.94 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  37.74 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.17 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  27.66 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  31.58 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.03 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  32.48 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  36.21 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  28.21 
 
 		 389 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  29.66 
 
 		 333 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  24.73 
 
 		 616 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  30.56 
 
 		 1367 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0352  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.92 
 
 		 426 aa  53.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.96 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  28.24 
 
 		 1510 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.81 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  35.34 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  30.56 
 
 		 1367 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  37.74 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  37.74 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  37.74 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0845  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  37.74 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  37.74 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  37.74 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  37.74 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  28.92 
 
 		 1476 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  36.79 
 
 		 244 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  36.79 
 
 		 244 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  36.79 
 
 		 244 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.33 
 
 		 237 aa  51.6  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  33.02 
 
 		 242 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.06 
 
 		 328 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.17 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.31 
 
 		 239 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  30.77 
 
 		 457 aa  51.2  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  27.64 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0421  helicase/exonuclease  24.68 
 
 		 870 aa  51.2  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.25 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  35.24 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.62 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  27.65 
 
 		 1485 aa  50.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.5 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2365  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000172168  hitchhiker  0.00918938 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  29.09 
 
 		 1390 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.79 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.82 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.32 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.56 
 
 		 442 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  30.08 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  35.34 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3993  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.89 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0718563  normal  0.0295208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2256  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.14 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.75 
 
 		 406 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.83 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.82 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.47 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.82 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.7 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.08 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>