More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0108 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  55.56 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.43 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.89 
 
 		 230 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.71 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  56.32 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.05 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.14 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.56 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.78 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  54.97 
 
 		 229 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.97 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.09 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.47 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  49.33 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  49.33 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.65 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.09 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.29 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  58.86 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.14 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.72 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.64 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.86 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.75 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.02 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.81 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.37 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.6 
 
 		 243 aa  201  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.21 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.64 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  45.53 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.15 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.86 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.19 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.7 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0749  DNA polymerase III subunit epsilon  46.58 
 
 		 245 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.249034 
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.81 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.64 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.1 
 
 		 243 aa  193  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.44 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.45 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.25 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3393  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.68 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.49 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.85 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.84 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.22 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0289  DNA polymerase III subunit epsilon  45.11 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0228111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0287  DNA polymerase III subunit epsilon  45.11 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0308  DNA polymerase III subunit epsilon  45.11 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0302  DNA polymerase III subunit epsilon  45.11 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0912  DNA polymerase III subunit epsilon  43.27 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.51 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0294  DNA polymerase III subunit epsilon  45.11 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0831172  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0229  DNA polymerase III subunit epsilon  44.26 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0164844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0227  DNA polymerase III subunit epsilon  44.26 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0218  DNA polymerase III subunit epsilon  44.26 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00177967  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.98 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0211  DNA polymerase III subunit epsilon  44.26 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  46.44 
 
 		 236 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0221  DNA polymerase III subunit epsilon  44.26 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3466  DNA polymerase III subunit epsilon  44.03 
 
 		 254 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  42.37 
 
 		 242 aa  188  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.92 
 
 		 239 aa  187  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00208  DNA polymerase III subunit epsilon  43.83 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3450  DNA polymerase III subunit epsilon  43.83 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.258177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00213  hypothetical protein  43.83 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.81 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.37 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  45.29 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.96 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4141  DNA polymerase III subunit epsilon  42.74 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1724  DNA polymerase III subunit epsilon  42.74 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0473  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.86 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.191106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  45.77 
 
 		 244 aa  185  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.89 
 
 		 231 aa  185  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  52 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  50.77 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.98 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03210  DNA polymerase III subunit epsilon  44.21 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02468  DNA polymerase III subunit epsilon  42.02 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.650155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3713  DNA polymerase III subunit epsilon  43.39 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.06 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.98 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.98 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.28 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  43.64 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  45.76 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.21 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.31 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.66 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  42.68 
 
 		 252 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.41 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  44.07 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  42.5 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  42.5 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  41.38 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>