67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0352 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0352  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 426 aa  853    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0836  conserved hypothetical protein, putative exonuclease  38.04 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000965957  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0218  exonuclease  30.68 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4217  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.88 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.77511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0012  DNA polymerase III fragment  27.57 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2362  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.02 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.13 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.5 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0181  putative exonuclease  23.26 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  0.100194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2319  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.49 
 
 		 217 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127163  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4659  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.8 
 
 		 203 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.102752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 189 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.929727  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0139  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.92 
 
 		 190 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0192788 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0473  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.98 
 
 		 240 aa  52.4  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.191106  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1764  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.92 
 
 		 191 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.387329  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0925  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.01 
 
 		 246 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.33 
 
 		 205 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1790  exonuclease  36.11 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.37 
 
 		 191 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.192375  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0559  exonuclease  29.88 
 
 		 234 aa  51.2  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3499  exonuclease  25.14 
 
 		 198 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108148  hitchhiker  4.31103e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 		 927 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.15 
 
 		 203 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1295  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.67 
 
 		 200 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.961159  normal  0.477064 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0621  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  23.23 
 
 		 259 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0816  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.29 
 
 		 206 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0007  YacC  28.92 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06771  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  23.23 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.921646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  31.13 
 
 		 1367 aa  47.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  31.13 
 
 		 1367 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  27.91 
 
 		 245 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  27.33 
 
 		 245 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.63 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  23.93 
 
 		 616 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3823  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.71 
 
 		 200 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.96 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.63 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06801  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.221498  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00208  DNA polymerase III subunit epsilon  27.93 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00213  hypothetical protein  27.93 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06471  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  22.58 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.71 
 
 		 237 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0229  DNA polymerase III subunit epsilon  27.93 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0164844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3450  DNA polymerase III subunit epsilon  27.93 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.258177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.53 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3393  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.93 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0211  DNA polymerase III subunit epsilon  27.93 
 
 		 243 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0227  DNA polymerase III subunit epsilon  27.93 
 
 		 243 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.45 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0218  DNA polymerase III subunit epsilon  27.93 
 
 		 243 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00177967  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06861  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  24.36 
 
 		 270 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0221  DNA polymerase III subunit epsilon  27.93 
 
 		 243 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  26.07 
 
 		 1390 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.27 
 
 		 234 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  27.55 
 
 		 250 aa  43.9  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0421  helicase/exonuclease  26.51 
 
 		 870 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.73 
 
 		 244 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  28.83 
 
 		 254 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2682  DNA polymerase III subunit epsilon  28.83 
 
 		 254 aa  43.1  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  28.83 
 
 		 254 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.14 
 
 		 921 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  21.78 
 
 		 345 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.19 
 
 		 233 aa  43.1  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0768  exonuclease  24.42 
 
 		 207 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.55 
 
 		 769 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>