More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0012 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0012  DNA polymerase III fragment  100 
 
 
287 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2319  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.83 
 
 
217 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127163  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.47 
 
 
293 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.68 
 
 
201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3499  exonuclease  40.23 
 
 
198 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108148  hitchhiker  4.31103e-25 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2362  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.93 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0181  putative exonuclease  31.28 
 
 
289 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  0.100194 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4217  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.22 
 
 
302 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.77511  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.42 
 
 
330 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02308  hypothetical protein  37.13 
 
 
217 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4659  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.87 
 
 
203 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003462  DNA polymerase III alpha subunit (gram-positive type)  35.93 
 
 
205 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0007  YacC  27.24 
 
 
282 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292935  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  33.53 
 
 
1465 aa  79.3  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3002  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.25 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.82 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.81 
 
 
240 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.86 
 
 
609 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.22 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  29.07 
 
 
584 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  39.6 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  28.4 
 
 
570 aa  72  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  33.87 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.55 
 
 
595 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.43 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  32.91 
 
 
1433 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.43 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  33.54 
 
 
1407 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.61 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  37.5 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  32.73 
 
 
603 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  26.15 
 
 
645 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.19 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.61 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  26.98 
 
 
617 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  31.25 
 
 
1449 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  31.25 
 
 
1449 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.42 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  33.64 
 
 
613 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.46 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  37.89 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  37.89 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  30.99 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.61 
 
 
610 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.91 
 
 
605 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  38.14 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.24 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  26.79 
 
 
578 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.76 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  30.91 
 
 
1365 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  27.55 
 
 
574 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  26.79 
 
 
566 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.14 
 
 
205 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.46 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  30.43 
 
 
574 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  29.07 
 
 
1397 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.62 
 
 
235 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.11 
 
 
695 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  41.24 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  37.11 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  28.4 
 
 
601 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  38.95 
 
 
1442 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  28.31 
 
 
485 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.05 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.19 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.96 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  29.59 
 
 
590 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.62 
 
 
463 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1764  DNA polymerase III subunit epsilon  36.84 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.743789  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  35.96 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.84 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  35.96 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  37.89 
 
 
252 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  35.48 
 
 
695 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.48 
 
 
695 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.69 
 
 
232 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  35.96 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.54 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  35.96 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.95 
 
 
498 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.88 
 
 
449 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  35.96 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  36.08 
 
 
244 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.77 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.5 
 
 
453 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  29.01 
 
 
578 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  36.46 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  33.13 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.79 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  30.77 
 
 
1362 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  36.08 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.65 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.68 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3713  DNA polymerase III subunit epsilon  36.08 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687255  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  25.37 
 
 
720 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  29.09 
 
 
601 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>