More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0498 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  97.5 
 
 
240 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  92.92 
 
 
240 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1938  exodeoxyribonuclease X  39.47 
 
 
222 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.652538  hitchhiker  0.0098923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  41.01 
 
 
223 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1371  exodeoxyribonuclease X  36.24 
 
 
232 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000325159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2032  exodeoxyribonuclease X  36.24 
 
 
232 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2120  exodeoxyribonuclease X  36.52 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1788  exodeoxyribonuclease X  36.52 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2580  exodeoxyribonuclease X  36.52 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1246  exodeoxyribonuclease X  35.81 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2415  exodeoxyribonuclease X  36.8 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01815  exodeoxyribonuclease X  36.52 
 
 
220 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.52 
 
 
220 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01803  hypothetical protein  36.52 
 
 
220 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2074  exodeoxyribonuclease X  36.52 
 
 
220 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1935  exodeoxyribonuclease X  36.52 
 
 
220 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2037  exodeoxyribonuclease X  35.81 
 
 
232 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1342  exodeoxyribonuclease X  36.52 
 
 
220 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.214775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2092  exodeoxyribonuclease X  35.37 
 
 
232 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.82 
 
 
565 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.43 
 
 
659 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1790  exonuclease  31.43 
 
 
247 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  35.56 
 
 
232 aa  99  6e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.38 
 
 
205 aa  95.9  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0326  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.79 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.242447 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0559  exonuclease  26.94 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0925  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.92 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1767  exodeoxyribonuclease X, putative  32.17 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1442  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.17 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0697655  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.34 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 
168 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.15 
 
 
479 aa  89.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  32.82 
 
 
1449 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  37.06 
 
 
695 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.47 
 
 
695 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  35.18 
 
 
707 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.2 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.29 
 
 
695 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  37.65 
 
 
570 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  32.31 
 
 
1449 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 
1444 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  32.43 
 
 
1442 aa  85.1  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  38.27 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6608  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.2 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0307436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.58 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  36.18 
 
 
729 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.79 
 
 
706 aa  82.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  33.14 
 
 
1433 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  36.31 
 
 
714 aa  82  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.15 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.25 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.84 
 
 
631 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2213  exonuclease  31.25 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  35.03 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.29 
 
 
769 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  27.2 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.3 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  35.58 
 
 
574 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  27.56 
 
 
1407 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  31.58 
 
 
222 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  31.91 
 
 
485 aa  78.6  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  34.71 
 
 
1440 aa  78.6  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  30.51 
 
 
1421 aa  78.6  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.41 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0908  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.11 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  32 
 
 
595 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.5 
 
 
610 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  30.91 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  31.1 
 
 
315 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40.82 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  31.1 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  31.1 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1420  DNA-directed DNA polymerase  34.32 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  31.1 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  36.6 
 
 
617 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.49 
 
 
605 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1347  DNA polymerase III epsilon subunit  25.19 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000179804  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.5 
 
 
731 aa  76.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  31.1 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.75 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  31.1 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.65 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.75 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2559  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.41 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.65 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2157  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.41 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000679182  normal  0.0877249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2234  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.41 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.97 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.13 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.64 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  34.12 
 
 
584 aa  75.5  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.3 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  32.09 
 
 
1433 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.71 
 
 
729 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  31.91 
 
 
1433 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  31.91 
 
 
1433 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>