143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_06801 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_06801  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.221498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  97.6 
 
 		 292 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07261  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  65.49 
 
 		 245 aa  329  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19021  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  63.27 
 
 		 321 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1315  exonuclease  65.35 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1142  DNA polymerase III, epsilon subunit  62.72 
 
 		 280 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0621  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  57.27 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06471  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  56.36 
 
 		 259 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06861  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  49.43 
 
 		 270 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06771  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  55.91 
 
 		 259 aa  271  9e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.921646  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0261  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.81 
 
 		 237 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  28.44 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  28.44 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  28.44 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  27.52 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2021  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.63 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.688906  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6601  DNA polymerase III subunit epsilon  28.24 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  28.18 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5660  DNA polymerase III subunit epsilon  26.7 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2198  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.81 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000342988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0240  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.35 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1138  DNA polymerase III subunit epsilon  27.6 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3054  DNA polymerase III subunit epsilon  28.51 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  31.74 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3049  DNA polymerase III subunit epsilon  27.7 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112048  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5175  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.631656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  29.71 
 
 		 1367 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  29.71 
 
 		 1367 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.11 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.06 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6581  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.64 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2022  DNA polymerase III subunit epsilon  26.92 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  28.05 
 
 		 1440 aa  56.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  29.14 
 
 		 1421 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  26.15 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1206  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.4 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  27.81 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  29.11 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  25.54 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  25.68 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  25.27 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  25.68 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  25.68 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  28.17 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  25.68 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  25.54 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3807  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.84 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000370728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.78 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0928  hypothetical protein  29.7 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.52 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.48 
 
 		 595 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.9 
 
 		 769 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  27.23 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1516  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  22.89 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845972  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.24 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  24.38 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.52 
 
 		 240 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2368  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.22 
 
 		 226 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0245873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  29.59 
 
 		 1397 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.53 
 
 		 956 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  25.65 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  26.2 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1583  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  22.89 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  28.98 
 
 		 1449 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  29.55 
 
 		 1449 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  26.82 
 
 		 1433 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  32.74 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0426  helicase, UvrD/REP/exonuclease family protein  23.35 
 
 		 870 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.79 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  30.29 
 
 		 1402 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.67 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.13 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.9 
 
 		 722 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1577  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  21.69 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.91 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  24.55 
 
 		 1390 aa  47.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.86 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.09 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.38 
 
 		 547 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.89 
 
 		 201 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  32.14 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.16 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1400  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.77 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.207546 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.4 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.11 
 
 		 944 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.57 
 
 		 706 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  26.51 
 
 		 1442 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.71 
 
 		 719 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0421  helicase/exonuclease  23.35 
 
 		 870 aa  45.8  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  23.32 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1647  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  26.84 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000174997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.12 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4173  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.82 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2256  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.64 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313606 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0352  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.48 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6601  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.74 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.75 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187406  hitchhiker  0.0000370659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  28.65 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2355  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.75 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.93 
 
 		 966 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>