More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0928 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0928  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  476  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.16 
 
 		 595 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  29.89 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  32 
 
 		 1493 aa  70.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  31.21 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  31.52 
 
 		 1433 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  30.1 
 
 		 584 aa  69.7  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  29.59 
 
 		 570 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.43 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.76 
 
 		 978 aa  69.3  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  32.54 
 
 		 1367 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  31.93 
 
 		 1426 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  32.54 
 
 		 1367 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  31.52 
 
 		 1390 aa  66.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1436 aa  65.9  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  32.28 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1438 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1438 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 595 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 315 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  29.76 
 
 		 1421 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  32.24 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  31.95 
 
 		 1442 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  31.58 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  35.06 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.87 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  30.9 
 
 		 1043 aa  63.2  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  34.68 
 
 		 1440 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1647  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  28.48 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000174997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.21 
 
 		 921 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.64 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  32.24 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.18 
 
 		 966 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  33.77 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  32.12 
 
 		 1362 aa  62  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  31.82 
 
 		 1444 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.64 
 
 		 929 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1296  DNA polymerase III subunit epsilon  31.49 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  31.21 
 
 		 578 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  35 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.8 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  33.97 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  32.56 
 
 		 1397 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  28.42 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1420  DNA-directed DNA polymerase  31.07 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.2 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  30.69 
 
 		 986 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  30.81 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1361  DNA polymerase III subunit epsilon  32.43 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  29.08 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  31.76 
 
 		 1437 aa  60.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.21 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.18 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.53 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.89 
 
 		 944 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 		 631 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  27.6 
 
 		 613 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  28.24 
 
 		 585 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.41 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.98 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.29 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.24 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.48 
 
 		 956 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.21 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0845  DNA polymerase III subunit epsilon  32.42 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  27.88 
 
 		 1449 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.87 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  34.44 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.69 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  27.88 
 
 		 1449 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0872  exonuclease I  25.73 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.759367  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  27.04 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  29.34 
 
 		 1447 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.63 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  28.42 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  32.26 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.02 
 
 		 565 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.04 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.98 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3729  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.74 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  28.42 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  27.19 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  28.65 
 
 		 584 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.65 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  34.38 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.99 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1071  Exodeoxyribonuclease I  27 
 
 		 495 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.07 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.81 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2155  DNA-directed DNA polymerase  31.64 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>