111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19021 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_19021  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 321 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07261  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  69.57 
 
 		 245 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1142  DNA polymerase III, epsilon subunit  64.29 
 
 		 280 aa  352  7e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1315  exonuclease  63.36 
 
 		 307 aa  342  5.999999999999999e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06801  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  63.27 
 
 		 292 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.221498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  62.39 
 
 		 292 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06861  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  53.12 
 
 		 270 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0621  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  54.09 
 
 		 259 aa  281  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06471  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  53.64 
 
 		 259 aa  281  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06771  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  53.64 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.921646  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0261  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.45 
 
 		 237 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  25.35 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  25.35 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  27.88 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2198  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.6 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000342988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2021  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.17 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.688906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  27.48 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0240  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.87 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5660  DNA polymerase III subunit epsilon  28.7 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6601  DNA polymerase III subunit epsilon  27.5 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.74 
 
 		 205 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.22 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1138  DNA polymerase III subunit epsilon  26.47 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.91 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3049  DNA polymerase III subunit epsilon  25.2 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112048  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3054  DNA polymerase III subunit epsilon  27.31 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.91 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  27.9 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.91 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5175  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.78 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.631656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2022  DNA polymerase III subunit epsilon  27.49 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1206  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.55 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1400  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.11 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.207546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6581  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.81 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  27.17 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  26.52 
 
 		 1367 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  26.52 
 
 		 1367 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.3 
 
 		 230 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  25 
 
 		 1440 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  25.97 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  26.74 
 
 		 228 aa  49.7  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3807  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.43 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000370728  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0449  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.46 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.77 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2368  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.27 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0245873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.49 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  25.41 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.46 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2037  exodeoxyribonuclease X  30.54 
 
 		 232 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2032  exodeoxyribonuclease X  30.54 
 
 		 232 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1246  exodeoxyribonuclease X  30.54 
 
 		 232 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940165  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1371  exodeoxyribonuclease X  30.54 
 
 		 232 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000325159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  28.4 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0700  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.4 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2092  exodeoxyribonuclease X  30.54 
 
 		 232 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  25.41 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2858  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.74 
 
 		 198 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  25.41 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.45 
 
 		 595 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  29.29 
 
 		 1388 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  25.41 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  25.41 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  25.41 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  26.54 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2255  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.86 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.9 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.24 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.29 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.87 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  28.32 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 		 610 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1935  exodeoxyribonuclease X  29.59 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1788  exodeoxyribonuclease X  29.59 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2120  exodeoxyribonuclease X  29.59 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.34 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2580  exodeoxyribonuclease X  29.59 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.3 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01815  exodeoxyribonuclease X  29.59 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.59 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4955  exonuclase  27.11 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  24.86 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  24.86 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.59 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  29.88 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.58 
 
 		 186 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2074  exodeoxyribonuclease X  29.59 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1342  exodeoxyribonuclease X  29.59 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214775 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  24.72 
 
 		 1433 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01803  hypothetical protein  29.59 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 		 218 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1549  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.7 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.418832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.58 
 
 		 186 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0845  DNA polymerase III subunit epsilon  26.38 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  28.75 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.99 
 
 		 532 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.37 
 
 		 203 aa  43.5  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5303  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.63 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>