More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6601 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6601  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 		 326 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020877 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5660  DNA polymerase III subunit epsilon  89.26 
 
 		 326 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  72.49 
 
 		 308 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  64.71 
 
 		 326 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  59.5 
 
 		 332 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  59.19 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  60.56 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1138  DNA polymerase III subunit epsilon  50 
 
 		 276 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3054  DNA polymerase III subunit epsilon  47.22 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3049  DNA polymerase III subunit epsilon  45.49 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112048  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5175  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.3 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.631656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2022  DNA polymerase III subunit epsilon  45.68 
 
 		 296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6581  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.3 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6601  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.16 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2198  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.16 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000342988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2021  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.77 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.688906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0240  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.25 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6467  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.47 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.808428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0449  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.46 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3807  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.84 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000370728  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4173  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.92 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  31.86 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1206  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.09 
 
 		 276 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  36.94 
 
 		 1426 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06801  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  28.24 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.221498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  27.23 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  34.94 
 
 		 570 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  35.93 
 
 		 578 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  27.97 
 
 		 1421 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06861  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  24.41 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19021  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  27.5 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  34.57 
 
 		 1440 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  35.8 
 
 		 1449 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  35.8 
 
 		 1449 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0621  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  24.76 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.88 
 
 		 595 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06771  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  24.76 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.921646  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06471  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  24.29 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  33.74 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07261  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  25.34 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  35.37 
 
 		 574 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1142  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.27 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  33.12 
 
 		 1407 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.15 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  32.12 
 
 		 1367 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  33.54 
 
 		 1433 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  32.12 
 
 		 1367 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.12 
 
 		 978 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.56 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  32.45 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  35.12 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  32.3 
 
 		 1442 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  38.94 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  36.67 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  33.16 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  31 
 
 		 565 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.73 
 
 		 610 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.34 
 
 		 715 aa  63.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  26.83 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  26.34 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  33.89 
 
 		 603 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  33.74 
 
 		 1397 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  38.33 
 
 		 566 aa  62.8  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  26.34 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  29.87 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  29.87 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  39.6 
 
 		 560 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  29.52 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  29.22 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  33.53 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.9 
 
 		 921 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  32.62 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  32.09 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  31.82 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  32.62 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  30 
 
 		 1527 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  25.85 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  28.4 
 
 		 1447 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  25.85 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.31 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1315  exonuclease  27.06 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  41.58 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0088  DNA polymerase III subunit alpha  32.97 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  29.45 
 
 		 1465 aa  60.1  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  31.31 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0012  DNA polymerase III fragment  29.71 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.25 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  37.37 
 
 		 986 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  25.85 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.58 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  36.54 
 
 		 1438 aa  58.5  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  29.29 
 
 		 203 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  35.96 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  29.22 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  30 
 
 		 578 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  49.25 
 
 		 952 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.03 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.64 
 
 		 605 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.22 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4061  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.69 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>