24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0261 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0261  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 237 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06801  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  35.81 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.221498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  35.35 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0621  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  32.48 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06471  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  31.33 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06771  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  32.19 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.921646  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06861  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  32.84 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07261  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19021  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  36.45 
 
 		 321 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1315  exonuclease  34.05 
 
 		 307 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1142  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.47 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1138  DNA polymerase III subunit epsilon  26.54 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2022  DNA polymerase III subunit epsilon  30.07 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4173  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.21 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  23.79 
 
 		 308 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  24.19 
 
 		 326 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  26.01 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  23.19 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  23.19 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6601  DNA polymerase III subunit epsilon  24.31 
 
 		 326 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6581  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.81 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  25.95 
 
 		 332 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5175  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.84 
 
 		 299 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.631656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2198  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.36 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000342988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>