170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06771 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_06771  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 259 aa  523  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.921646  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0621  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  93.44 
 
 		 259 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06471  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  92.66 
 
 		 259 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06861  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  75.93 
 
 		 270 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07261  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  59.01 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19021  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  53.64 
 
 		 321 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  56.36 
 
 		 292 aa  272  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06801  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  55.91 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.221498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1142  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.92 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1315  exonuclease  50.21 
 
 		 307 aa  256  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0261  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.19 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  26.24 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2021  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.13 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.688906  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  26.24 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  25.96 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2198  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.87 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000342988 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  32.75 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1138  DNA polymerase III subunit epsilon  25.69 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0240  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.76 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6601  DNA polymerase III subunit epsilon  24.76 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  29.63 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5660  DNA polymerase III subunit epsilon  24.76 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.37 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3054  DNA polymerase III subunit epsilon  24.19 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5175  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.83 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.631656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3049  DNA polymerase III subunit epsilon  23.56 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112048  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6581  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.05 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.54 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.75 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2022  DNA polymerase III subunit epsilon  22.95 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  26.25 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.68 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.31 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.72 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0449  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  22.91 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3807  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  23.22 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000370728  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1206  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.25 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.73 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  30.3 
 
 		 1397 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  29.45 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.95 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.22 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.71 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4173  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.52 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  28.83 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  29.19 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  30.81 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.66 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  24.55 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.99 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  19.65 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6601  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.22 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  30.67 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2479  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.46 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  30.67 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  25.75 
 
 		 1362 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.7 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  28.31 
 
 		 1367 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  30.3 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  28.31 
 
 		 1367 aa  49.3  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1371  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000325159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.18 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  30.67 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.73 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2037  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  29.88 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.71 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2032  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0352  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.23 
 
 		 426 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.24 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4098  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.89 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2092  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1246  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940165  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.99 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2621  DNA polymerase III subunit epsilon  22.38 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.12 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1400  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.23 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.207546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3993  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.09 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0718563  normal  0.0295208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 		 315 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.42 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  26.83 
 
 		 407 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 		 315 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 		 315 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 		 315 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  24.4 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.27 
 
 		 220 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1342  exodeoxyribonuclease X  27.27 
 
 		 220 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214775 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2120  exodeoxyribonuclease X  26.38 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2074  exodeoxyribonuclease X  27.27 
 
 		 220 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2580  exodeoxyribonuclease X  26.38 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1788  exodeoxyribonuclease X  27.27 
 
 		 220 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  27.44 
 
 		 986 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 		 315 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1935  exodeoxyribonuclease X  27.27 
 
 		 220 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0089  exonuclease  23.35 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.289343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.51 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 180 aa  45.8  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>