278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3807 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3807  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 304 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000370728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0240  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  49.84 
 
 		 302 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2198  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.54 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000342988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2021  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.54 
 
 		 302 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.688906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1138  DNA polymerase III subunit epsilon  41.2 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2022  DNA polymerase III subunit epsilon  42.07 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3054  DNA polymerase III subunit epsilon  38.7 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3049  DNA polymerase III subunit epsilon  37.25 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112048  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  35.57 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5660  DNA polymerase III subunit epsilon  37.2 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6601  DNA polymerase III subunit epsilon  35.84 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020877 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  35.35 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  35.35 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5175  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.46 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.631656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  33.67 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6581  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.59 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  34.68 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6601  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.81 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4173  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.33 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0449  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.16 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6467  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.3 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.808428 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  32.12 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1206  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.77 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  28.5 
 
 		 1440 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  29.65 
 
 		 1421 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.63 
 
 		 715 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.3 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.32 
 
 		 659 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 769 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  29.01 
 
 		 1449 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  29.01 
 
 		 1449 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.67 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  28.48 
 
 		 578 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  28.99 
 
 		 617 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.04 
 
 		 731 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  23.61 
 
 		 1442 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  25.7 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.9 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  23.67 
 
 		 1447 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.23 
 
 		 978 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  28.95 
 
 		 1527 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  31.01 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.65 
 
 		 631 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  31.21 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06771  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  23.22 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.921646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 595 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  33 
 
 		 560 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  27.84 
 
 		 1465 aa  56.6  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.24 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  26.79 
 
 		 1402 aa  56.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.85 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  28.75 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  29.76 
 
 		 970 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  24.49 
 
 		 1407 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.27 
 
 		 453 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.46 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.3 
 
 		 952 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 453 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  29.76 
 
 		 1433 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.1 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  29.76 
 
 		 1433 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  29.76 
 
 		 1433 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  29.76 
 
 		 1433 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  26.34 
 
 		 578 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  29.76 
 
 		 1433 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  30.19 
 
 		 379 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  29.76 
 
 		 1433 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1400  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.62 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.207546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  27.68 
 
 		 590 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  25.65 
 
 		 551 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  28.57 
 
 		 457 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  30.41 
 
 		 1433 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  30.95 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0626  exonuclease, putative  32.07 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0689924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.7 
 
 		 240 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  29.17 
 
 		 1433 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.69 
 
 		 729 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.08 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  29.75 
 
 		 1390 aa  53.9  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  27.71 
 
 		 570 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  29.82 
 
 		 1435 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  29.19 
 
 		 1438 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0621  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  22.85 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.27 
 
 		 398 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  29.94 
 
 		 1437 aa  53.5  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  29.19 
 
 		 1438 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0588  putative exonuclease  32.07 
 
 		 224 aa  53.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.83 
 
 		 442 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  29.17 
 
 		 1433 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.25 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  29.17 
 
 		 1433 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.25 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.25 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  27.44 
 
 		 1367 aa  52.8  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.15 
 
 		 196 aa  52.8  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.5 
 
 		 721 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  27.44 
 
 		 1367 aa  52.8  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  28.99 
 
 		 181 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  28.14 
 
 		 1444 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  25.76 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>