More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0626 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0626  exonuclease, putative  100 
 
 
224 aa  470  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0689924  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0588  putative exonuclease  99.55 
 
 
224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1400  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.57 
 
 
222 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.207546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1018  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.76 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.52 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.52 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.23 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  34.3 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  34.3 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3952  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.34 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.52 
 
 
235 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  33.53 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  34.3 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  33.73 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  34.12 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  31.74 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  34.32 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  32.34 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.73 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.9 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  32.97 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  32.42 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  33.14 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2148  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.09 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.91 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  33.72 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  32.56 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.74 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.4 
 
 
721 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  29.81 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  29.49 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.12 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.29 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.95 
 
 
769 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.8 
 
 
729 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  33.53 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.14 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.94 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.52 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.54 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.81 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.32 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2682  DNA polymerase III subunit epsilon  31.43 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  31.43 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  31.43 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  28.4 
 
 
527 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3993  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.74 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0718563  normal  0.0295208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  32.93 
 
 
1440 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.65 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.33 
 
 
532 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1764  DNA polymerase III subunit epsilon  31.28 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.743789  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.81 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2559  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.79 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.85 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  30.18 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002773  DNA polymerase III epsilon subunit  31.05 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.29 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.39 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.95 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.81 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.79 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.4 
 
 
719 aa  71.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2365  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.79 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000172168  hitchhiker  0.00918938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.56 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2607  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.38 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000048711  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  32.54 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.65 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.85 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0473  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.68 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.191106  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.13 
 
 
595 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03210  DNA polymerase III subunit epsilon  31.05 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  31.49 
 
 
1367 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.44 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  31.49 
 
 
1367 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  30.64 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.46 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 
731 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  35.15 
 
 
617 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.79 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.23 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.59 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2398  DNA polymerase III subunit epsilon  32.97 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.28 
 
 
921 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0400  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.55 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.18 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>