More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3952 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3952  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 169 aa  343  7e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  56.44 
 
 		 233 aa  175  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  56.44 
 
 		 233 aa  175  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3466  DNA polymerase III subunit epsilon  54.55 
 
 		 254 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  51.46 
 
 		 244 aa  167  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3713  DNA polymerase III subunit epsilon  54.55 
 
 		 252 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1724  DNA polymerase III subunit epsilon  54.55 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4141  DNA polymerase III subunit epsilon  54.55 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  50.29 
 
 		 245 aa  164  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  50.29 
 
 		 245 aa  164  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  48.19 
 
 		 236 aa  164  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.78 
 
 		 232 aa  164  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  51.76 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  51.76 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2682  DNA polymerase III subunit epsilon  51.76 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.92 
 
 		 241 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.4 
 
 		 257 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1764  DNA polymerase III subunit epsilon  50.6 
 
 		 259 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.743789  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.61 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03210  DNA polymerase III subunit epsilon  48.82 
 
 		 238 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2838  DNA polymerase III subunit epsilon  49.12 
 
 		 244 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  51.2 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.39 
 
 		 234 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002773  DNA polymerase III epsilon subunit  48.82 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0289  DNA polymerase III subunit epsilon  49.71 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0228111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0912  DNA polymerase III subunit epsilon  50.59 
 
 		 246 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0302  DNA polymerase III subunit epsilon  49.71 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0308  DNA polymerase III subunit epsilon  49.71 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0294  DNA polymerase III subunit epsilon  49.71 
 
 		 246 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0831172  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  49.11 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0287  DNA polymerase III subunit epsilon  49.71 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.998111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00208  DNA polymerase III subunit epsilon  48.54 
 
 		 243 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3393  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.54 
 
 		 246 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.17 
 
 		 267 aa  158  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0211  DNA polymerase III subunit epsilon  48.54 
 
 		 243 aa  158  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3450  DNA polymerase III subunit epsilon  48.54 
 
 		 246 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.258177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0218  DNA polymerase III subunit epsilon  48.54 
 
 		 243 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00177967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0221  DNA polymerase III subunit epsilon  48.54 
 
 		 243 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0227  DNA polymerase III subunit epsilon  48.54 
 
 		 243 aa  158  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0229  DNA polymerase III subunit epsilon  48.54 
 
 		 246 aa  158  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0164844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00213  hypothetical protein  48.54 
 
 		 243 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0603  DNA polymerase III subunit epsilon  47.62 
 
 		 252 aa  157  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.61 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0749  DNA polymerase III subunit epsilon  48.54 
 
 		 245 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.249034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.83 
 
 		 243 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.39 
 
 		 238 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.31 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2398  DNA polymerase III subunit epsilon  48.82 
 
 		 243 aa  154  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.83 
 
 		 235 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  46.71 
 
 		 252 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  49.09 
 
 		 244 aa  154  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 		 243 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  48.48 
 
 		 246 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.12 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  48.48 
 
 		 246 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 		 238 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.88 
 
 		 235 aa  151  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.56 
 
 		 237 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.08 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.56 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.56 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.37 
 
 		 237 aa  148  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2256  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.27 
 
 		 234 aa  148  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313606 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0473  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.38 
 
 		 240 aa  147  7e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.191106  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.63 
 
 		 236 aa  147  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.17 
 
 		 232 aa  147  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2148  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.38 
 
 		 235 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.24 
 
 		 239 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.11 
 
 		 239 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.17 
 
 		 532 aa  145  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  46.34 
 
 		 244 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.78 
 
 		 239 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1361  DNA polymerase III subunit epsilon  46.95 
 
 		 239 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.56 
 
 		 253 aa  144  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  46.63 
 
 		 240 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.93 
 
 		 234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02468  DNA polymerase III subunit epsilon  46.95 
 
 		 244 aa  143  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.650155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  44.79 
 
 		 242 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  44.17 
 
 		 527 aa  143  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2284  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.71 
 
 		 240 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1296  DNA polymerase III subunit epsilon  46.34 
 
 		 239 aa  143  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 249 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2365  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.65 
 
 		 242 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000172168  hitchhiker  0.00918938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  46.01 
 
 		 242 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  44.58 
 
 		 238 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  45.4 
 
 		 242 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1993  DNA-directed DNA polymerase  46.15 
 
 		 242 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000133992  hitchhiker  0.00000148516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2111  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.56 
 
 		 242 aa  141  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000449377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2157  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.06 
 
 		 242 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000679182  normal  0.0877249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2234  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.06 
 
 		 242 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.39 
 
 		 243 aa  140  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 253 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 253 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 253 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 253 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.97 
 
 		 242 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 253 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 240 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  45.73 
 
 		 240 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.01 
 
 		 231 aa  140  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>