257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6467 on replicon NC_010518
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010518  Mrad2831_6467  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.808428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6581  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.76 
 
 		 296 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6601  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  68.14 
 
 		 296 aa  362  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3049  DNA polymerase III subunit epsilon  48.98 
 
 		 298 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112048  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3054  DNA polymerase III subunit epsilon  48.3 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1138  DNA polymerase III subunit epsilon  47.29 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5175  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.26 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.631656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  44.17 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2022  DNA polymerase III subunit epsilon  50.89 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5660  DNA polymerase III subunit epsilon  42.81 
 
 		 326 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6601  DNA polymerase III subunit epsilon  41.81 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020877 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  41.87 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  43.36 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  43.36 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  43.36 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0240  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.97 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2021  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.1 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.688906  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3807  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.64 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000370728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2198  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.97 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000342988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0449  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.77 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  37.19 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4173  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1206  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.25 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.22 
 
 		 952 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  29.1 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.64 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  40.59 
 
 		 1426 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.41 
 
 		 944 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  29.18 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.84 
 
 		 934 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  34.74 
 
 		 1527 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  23.55 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.4 
 
 		 978 aa  60.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  28.85 
 
 		 566 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  38.38 
 
 		 986 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  25.62 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 		 956 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  34.04 
 
 		 1447 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.36 
 
 		 921 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  37.76 
 
 		 560 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  35.71 
 
 		 613 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  34.74 
 
 		 1449 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.05 
 
 		 595 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  23.55 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  23.14 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  36.63 
 
 		 1402 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  23.14 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  34.74 
 
 		 1449 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  34.26 
 
 		 1397 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  36.27 
 
 		 1465 aa  58.9  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  35.79 
 
 		 1421 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  23.14 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  23.14 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  35.79 
 
 		 1362 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  38.39 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.22 
 
 		 930 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.93 
 
 		 929 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  35.71 
 
 		 1407 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  30.21 
 
 		 578 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  23.14 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  30.25 
 
 		 1367 aa  55.8  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  30.25 
 
 		 1367 aa  55.8  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.52 
 
 		 449 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.95 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  32.32 
 
 		 1043 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06801  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.221498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2302  UvrD/REP helicase  30.45 
 
 		 829 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556709  normal  0.916479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  24.67 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.53 
 
 		 475 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  31.18 
 
 		 570 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  32.63 
 
 		 1442 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  36.89 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.45 
 
 		 927 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  32.52 
 
 		 574 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  37.89 
 
 		 1440 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  27.91 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  36.61 
 
 		 584 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  38.14 
 
 		 630 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  38.14 
 
 		 630 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  35 
 
 		 565 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.07 
 
 		 453 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  31.76 
 
 		 590 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.38 
 
 		 595 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  38.14 
 
 		 630 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.46 
 
 		 966 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  36.63 
 
 		 1444 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.22 
 
 		 631 aa  52.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0088  DNA polymerase III subunit alpha  34.58 
 
 		 235 aa  52.8  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 		 479 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.76 
 
 		 530 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.22 
 
 		 610 aa  52.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.19 
 
 		 395 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  23.26 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  34 
 
 		 1438 aa  52  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  28.87 
 
 		 1388 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.59 
 
 		 609 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.95 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  35.77 
 
 		 645 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>