119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1315 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1315  exonuclease  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1142  DNA polymerase III, epsilon subunit  66.43 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19021  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  63.36 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06801  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  65.35 
 
 		 292 aa  335  5e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.221498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  64.47 
 
 		 292 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07261  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  65.78 
 
 		 245 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0621  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  46.61 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06471  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  50.21 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06771  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  50.21 
 
 		 259 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.921646  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06861  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0261  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.48 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  26.03 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  26.03 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  26.36 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0240  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.14 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  27.19 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5660  DNA polymerase III subunit epsilon  25.44 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  26.27 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2021  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.29 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.688906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2198  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.51 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000342988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3049  DNA polymerase III subunit epsilon  27.48 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112048  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.94 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  28.45 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.94 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6601  DNA polymerase III subunit epsilon  25.57 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.73 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1138  DNA polymerase III subunit epsilon  26.73 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3054  DNA polymerase III subunit epsilon  27.03 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5175  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.27 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.631656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1206  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.75 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2022  DNA polymerase III subunit epsilon  27.8 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.27 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  28.72 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0449  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.61 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1400  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 		 222 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.207546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.77 
 
 		 228 aa  49.3  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  26.88 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  31.65 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  29.7 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.05 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  28.4 
 
 		 223 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.19 
 
 		 547 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.56 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3807  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.58 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000370728  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0626  exonuclease, putative  26.92 
 
 		 224 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0689924  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.29 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0588  putative exonuclease  26.92 
 
 		 224 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.57 
 
 		 595 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  24.07 
 
 		 250 aa  47  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  29.35 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.19 
 
 		 406 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.76 
 
 		 237 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6581  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.77 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.51 
 
 		 721 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.65 
 
 		 218 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2368  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.51 
 
 		 226 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0245873 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  25.27 
 
 		 1367 aa  45.8  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2092  exodeoxyribonuclease X  30.43 
 
 		 232 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  24.85 
 
 		 1440 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  23.33 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  30.58 
 
 		 1468 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  30.25 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  29.07 
 
 		 719 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0928  hypothetical protein  26.84 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  22.91 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  25.27 
 
 		 1367 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2037  exodeoxyribonuclease X  30.43 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2032  exodeoxyribonuclease X  30.43 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.93 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1246  exodeoxyribonuclease X  30.43 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940165  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1371  exodeoxyribonuclease X  30.43 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000325159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  23.33 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  23.33 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.01 
 
 		 769 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1516  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.56 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845972  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.93 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  27.57 
 
 		 1464 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2858  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0909  DNA polymerase III subunit epsilon  28.81 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0718919  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  29.13 
 
 		 1388 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  23.89 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1583  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.56 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  25.47 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2636  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.815418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2671  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2750  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1713  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  24.72 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  24.72 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  27.11 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0979  DNA polymerase III subunit epsilon  24.75 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1577  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.27 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  23.33 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  23.33 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.71 
 
 		 230 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1752  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.7 
 
 		 228 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.974863  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1788  exodeoxyribonuclease X  27.95 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2580  exodeoxyribonuclease X  27.95 
 
 		 220 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>