164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06471 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06471  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 
259 aa  524  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06771  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  92.66 
 
 
259 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.921646  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0621  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  91.89 
 
 
259 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06861  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  74.81 
 
 
270 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07261  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  59.28 
 
 
245 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19021  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  53.64 
 
 
321 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0059  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  56.82 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0332716  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06801  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  56.36 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.221498  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1142  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.38 
 
 
280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1315  exonuclease  50.21 
 
 
307 aa  258  8e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0261  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.33 
 
 
237 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2021  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.82 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.688906  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  25.88 
 
 
332 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  25.88 
 
 
332 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  25.21 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2198  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.92 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000342988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1138  DNA polymerase III subunit epsilon  25.68 
 
 
276 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  27.8 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  27.78 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0240  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.32 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6601  DNA polymerase III subunit epsilon  24.29 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020877 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5660  DNA polymerase III subunit epsilon  24.29 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606784  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3054  DNA polymerase III subunit epsilon  24.65 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.15 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3049  DNA polymerase III subunit epsilon  23.38 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112048  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5175  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.11 
 
 
299 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.631656  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2022  DNA polymerase III subunit epsilon  22.94 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.593569  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0449  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  23.17 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6581  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.05 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 
293 aa  59.7  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.23 
 
 
240 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.71 
 
 
205 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1206  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.16 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  28.83 
 
 
1397 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.71 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.11 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.22 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.61 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  27.5 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  30.67 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.47 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.36 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4173  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.47 
 
 
291 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.14 
 
 
239 aa  52  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  30.15 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 
242 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.66 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3807  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  21.51 
 
 
304 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000370728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  20.75 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2479  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6601  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.22 
 
 
296 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4098  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.44 
 
 
233 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  27.17 
 
 
1367 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  27.17 
 
 
1367 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  28.66 
 
 
217 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  29.65 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  25.75 
 
 
1362 aa  49.3  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.18 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1400  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.23 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.207546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  28.4 
 
 
1407 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 
180 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1647  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  27.17 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000174997  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  30.06 
 
 
1442 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1371  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000325159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  28.4 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  24.4 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0089  exonuclease  23.35 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.289343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2032  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 
232 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.786881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2037  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 
232 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2092  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 
232 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.65 
 
 
243 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.99 
 
 
595 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1246  exodeoxyribonuclease X  28.92 
 
 
232 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.32 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.38 
 
 
231 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  24.85 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  29.27 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0251  exonuclease  25.16 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.9 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.35 
 
 
240 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3993  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.54 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0718563  normal  0.0295208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.26 
 
 
233 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.68 
 
 
203 aa  45.8  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0352  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.58 
 
 
426 aa  45.8  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 
315 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.62 
 
 
966 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  25 
 
 
1433 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  26.83 
 
 
986 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>