259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5303 on replicon NC_010182
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010182  BcerKBAB4_5303  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 271 aa  554  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  32.75 
 
 		 1433 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  30 
 
 		 1437 aa  76.6  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  31.36 
 
 		 1449 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  28.96 
 
 		 1447 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  30.77 
 
 		 1449 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  31.79 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  31.79 
 
 		 1397 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.81 
 
 		 609 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 584 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  29.05 
 
 		 578 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  28.88 
 
 		 601 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.8 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  32.16 
 
 		 1402 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  28.57 
 
 		 1465 aa  69.7  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 595 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  30.98 
 
 		 1407 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  31.03 
 
 		 1433 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  30.43 
 
 		 574 aa  68.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.47 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  29.83 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  27.03 
 
 		 1421 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  28.99 
 
 		 1426 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  29.05 
 
 		 1367 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  29.05 
 
 		 1367 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  30.11 
 
 		 1444 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  29.38 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  28.02 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.42 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.8 
 
 		 952 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  28.57 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.02 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  27.84 
 
 		 970 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  31.25 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.53 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  31.25 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  31.25 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  29.03 
 
 		 617 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  29.14 
 
 		 1435 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  26.9 
 
 		 1438 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.02 
 
 		 631 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  26.9 
 
 		 1438 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  24.74 
 
 		 1436 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  26.92 
 
 		 616 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  29.24 
 
 		 1442 aa  62.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  27.27 
 
 		 1433 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  27.27 
 
 		 1433 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  27.27 
 
 		 1433 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  27.67 
 
 		 720 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  29.24 
 
 		 1440 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  27.27 
 
 		 1433 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  27.27 
 
 		 1433 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  27.27 
 
 		 1433 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  28.41 
 
 		 1433 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  27.27 
 
 		 1433 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  27.27 
 
 		 1433 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.87 
 
 		 584 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  29.82 
 
 		 1390 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  29.05 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  28.25 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  25.11 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.13 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.19 
 
 		 921 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.81 
 
 		 921 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  27.32 
 
 		 601 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 707 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.14 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  29.52 
 
 		 986 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  25 
 
 		 570 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.01 
 
 		 966 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.29 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1068  DNA polymerase III, epsilon chain  32.69 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2021  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.89 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.688906  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  26.74 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.75 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.98 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  28.48 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.9 
 
 		 595 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.38 
 
 		 769 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  26.63 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  25.44 
 
 		 1527 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0251  exonuclease  27.95 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  26.37 
 
 		 578 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2007  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.41 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6094  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.41 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0666129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1983  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.41 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.45 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0502  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.71 
 
 		 659 aa  55.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.93 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1027  DNA polymerase III subunit epsilon  28.14 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.512461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0379  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.27 
 
 		 482 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  25.63 
 
 		 1437 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0381  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  0.331802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.41 
 
 		 453 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  26.92 
 
 		 613 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.12 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>