85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0836 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0836  conserved hypothetical protein, putative exonuclease  100 
 
 		 459 aa  934    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000965957  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0352  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.04 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4217  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32 
 
 		 302 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.77511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.84 
 
 		 330 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3499  exonuclease  31.02 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108148  hitchhiker  4.31103e-25 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  29.82 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.49 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2319  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.93 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127163  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0007  YacC  26.98 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  25.22 
 
 		 929 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.31 
 
 		 695 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.49 
 
 		 204 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.16 
 
 		 719 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.42 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  25.77 
 
 		 205 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0012  DNA polymerase III fragment  35.11 
 
 		 287 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2362  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.44 
 
 		 201 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.28 
 
 		 934 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  24.75 
 
 		 250 aa  51.2  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  27.03 
 
 		 313 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.47 
 
 		 547 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0181  putative exonuclease  24 
 
 		 289 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  0.100194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  24.4 
 
 		 719 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3376  DNA polymerase III subunit epsilon  26.6 
 
 		 326 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.16 
 
 		 695 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  28.16 
 
 		 695 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1206  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.25 
 
 		 276 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  26.11 
 
 		 1390 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  34.62 
 
 		 231 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  28.8 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.47 
 
 		 731 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5270  DNA polymerase III subunit epsilon  23.3 
 
 		 308 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.6 
 
 		 293 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0626  exonuclease, putative  27.13 
 
 		 224 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0689924  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  30.33 
 
 		 236 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0588  putative exonuclease  29.51 
 
 		 224 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.71 
 
 		 706 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  27.03 
 
 		 1367 aa  47.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.46 
 
 		 239 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  27.03 
 
 		 1367 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 242 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0564  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.1 
 
 		 248 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.68 
 
 		 233 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0400  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.1 
 
 		 248 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2302  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 829 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556709  normal  0.916479 
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.01 
 
 		 231 aa  46.2  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02308  hypothetical protein  36.54 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  32.69 
 
 		 234 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  32.69 
 
 		 234 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35 
 
 		 203 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.9 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  25.85 
 
 		 707 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.68 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.85 
 
 		 180 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 769 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5660  DNA polymerase III subunit epsilon  26.15 
 
 		 326 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1294  DNA polymerase III subunit epsilon  27.23 
 
 		 332 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.71 
 
 		 189 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.929727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.9 
 
 		 241 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  25.76 
 
 		 218 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.41 
 
 		 927 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1006  DNA polymerase III subunit epsilon  26.11 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0925  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.31 
 
 		 246 aa  44.3  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.25 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0948  DNA polymerase III subunit epsilon  26.11 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.26 
 
 		 243 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003462  DNA polymerase III alpha subunit (gram-positive type)  34.65 
 
 		 205 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  25.71 
 
 		 584 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.63 
 
 		 234 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.16 
 
 		 659 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.7 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.1 
 
 		 234 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.45 
 
 		 239 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2183  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.82 
 
 		 233 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  31.96 
 
 		 245 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0536  DNA polymerase III subunit epsilon  26.74 
 
 		 218 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.93 
 
 		 532 aa  43.5  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  31.96 
 
 		 527 aa  43.5  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2284  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.91 
 
 		 240 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.63 
 
 		 230 aa  43.5  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.87 
 
 		 191 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.192375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  31.96 
 
 		 240 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  25.86 
 
 		 1397 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3952  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.29 
 
 		 169 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>