168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_15120 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_15120  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 		 228 aa  460  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2759  DNA polymerase III subunit epsilon  55.41 
 
 		 254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.137424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2481  DNA polymerase III subunit epsilon  52.47 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000473559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1180  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50.88 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0687091  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0183  DNA polymerase III subunit epsilon  44.35 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5634  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.37 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247829  normal  0.015317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1509  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.26 
 
 		 295 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.89 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.865455  normal  0.183971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3445  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.14 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0147122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0314  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.92 
 
 		 243 aa  161  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.124129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0688  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.98 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.219348  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08720  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  38.2 
 
 		 238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28650  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  41.36 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.50801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0640  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.83 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.893813  normal  0.641508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5735  DNA polymerase III subunit epsilon  37.72 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3054  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.27 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.210781 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0468  exonuclease  30.57 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0008  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.15 
 
 		 258 aa  72  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.970645  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4987  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.38 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  31.4 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.12 
 
 		 769 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.75 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.25 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  29.76 
 
 		 1468 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13583  putative DNA polymerase III epsilon chain  29.38 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2340  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.19 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.684331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  28.18 
 
 		 1485 aa  58.9  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1347  DNA polymerase III epsilon subunit  27.17 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000179804  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.19 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.73 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  30.86 
 
 		 1442 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.1 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  30.25 
 
 		 1440 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.66 
 
 		 731 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  29.09 
 
 		 1464 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.61 
 
 		 1433 aa  55.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  25.95 
 
 		 1443 aa  55.1  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  24.88 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1044  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.34 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.69033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3263  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.85 
 
 		 550 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.71 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  27.38 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4768  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.02 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.392412  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.92 
 
 		 722 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  29.41 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.75 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4643  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.02 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.7 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.03 
 
 		 308 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  29.71 
 
 		 345 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.41 
 
 		 406 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.44 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  25.64 
 
 		 1454 aa  51.6  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0528  exonuclease  29.8 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00892328  normal  0.16034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  25.95 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.44 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1852  exonuclease  29.31 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  27.16 
 
 		 1449 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  27.78 
 
 		 1449 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  29.21 
 
 		 333 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  27.12 
 
 		 1510 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4781  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.08 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  29.61 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  28.3 
 
 		 574 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  25.93 
 
 		 1407 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3900  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.27 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  28 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.51 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  27.14 
 
 		 714 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  26.22 
 
 		 707 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0832  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.86 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0668234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.72 
 
 		 605 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.84 
 
 		 187 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  27.78 
 
 		 1397 aa  48.5  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  26.58 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  26.58 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  28.16 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  27.15 
 
 		 1476 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0928  hypothetical protein  24.14 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.16 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2362  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.9 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  29.9 
 
 		 603 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 		 530 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.88 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0639  exonuclease  23.32 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0836  DNA polymerase III subunit epsilon  28.11 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  28.74 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2692  DNA polymerase III subunit epsilon  26.29 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  29.91 
 
 		 1438 aa  47  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.7 
 
 		 721 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.45 
 
 		 921 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  27.95 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  28.16 
 
 		 574 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.51 
 
 		 706 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.61 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  28.5 
 
 		 551 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.54 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.9 
 
 		 328 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>