184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0528 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0528  exonuclease  100 
 
 		 197 aa  410  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00892328  normal  0.16034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1726  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  51.09 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1051  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  51.09 
 
 		 189 aa  202  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.925098  hitchhiker  0.00013218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2382  exonuclease I  29.74 
 
 		 478 aa  62  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  30.11 
 
 		 1397 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.87 
 
 		 927 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  26.94 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.72 
 
 		 944 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.02 
 
 		 929 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  23.91 
 
 		 1433 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.41 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.47 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56080  exonuclease I  28.22 
 
 		 480 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  26.4 
 
 		 1440 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  23.37 
 
 		 1433 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  23.37 
 
 		 1433 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2250  hypothetical protein  25.97 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.04 
 
 		 1442 aa  54.7  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.08 
 
 		 956 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  22.83 
 
 		 970 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  22.83 
 
 		 1433 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  22.83 
 
 		 1433 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  22.83 
 
 		 1433 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  22.83 
 
 		 1433 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  22.83 
 
 		 1433 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  23.56 
 
 		 1426 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4884  exonuclease I  28.22 
 
 		 478 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.35 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  22.83 
 
 		 1433 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  22.83 
 
 		 1433 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.19 
 
 		 952 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0716  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.37 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.700864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 		 719 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0778  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.37 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0904  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.37 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2380  exodeoxyribonuclease I  27.36 
 
 		 484 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1023  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.37 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.76 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4316  exodeoxyribonuclease I  27.54 
 
 		 476 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  24.59 
 
 		 1437 aa  52  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  23.63 
 
 		 1435 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  25.95 
 
 		 584 aa  51.2  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3314  exonuclease I  27.62 
 
 		 481 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15120  DNA polymerase III subunit epsilon  29.8 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4438  exonuclease I  27.1 
 
 		 476 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1010  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.67 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0343997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  26.34 
 
 		 570 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1935  exonuclease I  28.79 
 
 		 482 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3445  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.62 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0147122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0637  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.26 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.11 
 
 		 715 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  28.27 
 
 		 611 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1180  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.9 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0687091  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  25.14 
 
 		 1407 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  25.13 
 
 		 1432 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0826  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.26 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.458335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.7 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2137  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.06 
 
 		 864 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1866  ribonuclease T  25.39 
 
 		 246 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00131644  normal  0.0390394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.37 
 
 		 930 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.04 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.82 
 
 		 921 aa  48.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3405  exonuclease I  28.28 
 
 		 479 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2600  exonuclease I  30.73 
 
 		 479 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186824  normal  0.262896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1680  exonuclease I  27.14 
 
 		 474 aa  48.5  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3059  exonuclease I  28.28 
 
 		 479 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  24.19 
 
 		 578 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1661  ribonuclease T  24.24 
 
 		 274 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000109903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.26 
 
 		 463 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  22.29 
 
 		 1433 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1762  exonuclease I  27.14 
 
 		 475 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  27.87 
 
 		 1444 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0966  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.7 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.92 
 
 		 706 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3236  exonuclease I  27.36 
 
 		 478 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  normal  0.286488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0266  exonuclease I  26.6 
 
 		 481 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00762  exonuclease I  29.65 
 
 		 481 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.41 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.27 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2034  exonuclease I  26.42 
 
 		 475 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.18 
 
 		 921 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  24.02 
 
 		 1449 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00168  DNA polymerase III subunit epsilon  21.23 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1005  exonuclease I  27.32 
 
 		 478 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000425826  hitchhiker  0.00000000000101458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38320  exonuclease I  26.19 
 
 		 476 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4020  exonuclease I  27.86 
 
 		 476 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.036552  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1633  ribonuclease T  24.87 
 
 		 239 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000360038  hitchhiker  0.000696557 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.86 
 
 		 659 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.04 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2436  exodeoxyribonuclease I  24.62 
 
 		 486 aa  45.1  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  21.47 
 
 		 1443 aa  45.1  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1451  exodeoxyribonuclease I  27.84 
 
 		 458 aa  45.1  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1518  exonuclease  27.84 
 
 		 458 aa  45.1  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  23.76 
 
 		 250 aa  44.7  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.57 
 
 		 410 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1611  exonuclease I  25.25 
 
 		 482 aa  44.7  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2394  exonuclease I  27.59 
 
 		 485 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  24.08 
 
 		 1402 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3505  exonuclease I  27.27 
 
 		 479 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584521  normal  0.826797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>