111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1726 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1726  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 185 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1051  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  74.32 
 
 		 189 aa  298  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.925098  hitchhiker  0.00013218 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0528  exonuclease  51.09 
 
 		 197 aa  204  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00892328  normal  0.16034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0778  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.03 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.32 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  30.85 
 
 		 1397 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0716  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.03 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.700864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0904  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.03 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0637  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.03 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0826  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.03 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.458335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0966  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.57 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1023  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.03 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  28.31 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1661  ribonuclease T  26.84 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000109903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 315 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  27.38 
 
 		 315 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 315 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  26.09 
 
 		 1367 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  26.09 
 
 		 1367 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.78 
 
 		 929 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1633  ribonuclease T  24.21 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000360038  hitchhiker  0.000696557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  28.31 
 
 		 299 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  27.78 
 
 		 1435 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0157  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  22.11 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.32351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4884  exonuclease I  29.53 
 
 		 478 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  26.06 
 
 		 551 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  26.98 
 
 		 1432 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.81 
 
 		 944 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  28.5 
 
 		 359 aa  49.7  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56080  exonuclease I  27.98 
 
 		 480 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.18 
 
 		 927 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  27.42 
 
 		 1527 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.97 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4200  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.91 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1866  ribonuclease T  23.68 
 
 		 246 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00131644  normal  0.0390394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.26 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  26.11 
 
 		 1443 aa  47.8  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  22.28 
 
 		 1390 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  28.33 
 
 		 1407 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38320  exonuclease I  27.08 
 
 		 476 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.98 
 
 		 921 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.11 
 
 		 952 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2450  ribonuclease T  25.27 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299626  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.14 
 
 		 706 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  25.14 
 
 		 1433 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4316  exodeoxyribonuclease I  27.6 
 
 		 476 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3314  exonuclease I  27.23 
 
 		 481 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2692  DNA polymerase III subunit epsilon  26.34 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.04 
 
 		 605 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4061  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.27 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  26.82 
 
 		 601 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  26.4 
 
 		 1449 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2268  ribonuclease T  30.65 
 
 		 216 aa  44.7  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.862019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0300  ribonuclease T  26.84 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  24.59 
 
 		 1433 aa  44.7  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.59 
 
 		 203 aa  44.7  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  24.18 
 
 		 578 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  24.86 
 
 		 1440 aa  44.7  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  24.59 
 
 		 970 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  24.59 
 
 		 1433 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  24.59 
 
 		 1433 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  24.59 
 
 		 1433 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  26.4 
 
 		 1449 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  25.56 
 
 		 1426 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1420  DNA-directed DNA polymerase  26.26 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  24.59 
 
 		 1433 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  24.59 
 
 		 1433 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  24.59 
 
 		 1433 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  24.59 
 
 		 1433 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2211  exonuclease I  27.32 
 
 		 476 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  24.58 
 
 		 1437 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2093  ribonuclease T  26.06 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000154544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.74 
 
 		 956 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  24.02 
 
 		 570 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2571  ribonuclease T  26.46 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000796721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2607  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000048711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2137  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.15 
 
 		 864 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14060  ribonuclease T  26.18 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  26.37 
 
 		 574 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0597  ribonuclease T  30.17 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0238382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  25.42 
 
 		 897 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  25.42 
 
 		 897 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.04 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2458  ribonuclease T  29.03 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.39 
 
 		 481 aa  42.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4020  exonuclease I  28.35 
 
 		 476 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.036552  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  24.46 
 
 		 1442 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  24.29 
 
 		 574 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  24.71 
 
 		 590 aa  41.6  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1520  ribonuclease T  25.39 
 
 		 257 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0577175  normal  0.681349 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  25.54 
 
 		 1433 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>