63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2342 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 181 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1965  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  52.05 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4200  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.2 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3679  hypothetical protein  46 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0147026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5807  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.92 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.983586  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3269  hypothetical protein  32.81 
 
 		 226 aa  95.5  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3269  hypothetical protein  32.81 
 
 		 215 aa  94.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2968  hypothetical protein  32.81 
 
 		 218 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3904  hypothetical protein  32.81 
 
 		 218 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3823  hypothetical protein  32.81 
 
 		 218 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1633  hypothetical protein  32.81 
 
 		 218 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3401  hypothetical protein  32.81 
 
 		 218 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0989061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1014  hypothetical protein  39.23 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2908  hypothetical protein  32.81 
 
 		 218 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3152  hypothetical protein  32.29 
 
 		 218 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3139  hypothetical protein  31.77 
 
 		 239 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3467  hypothetical protein  32.29 
 
 		 243 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0284  hypothetical protein  31.77 
 
 		 219 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2822  hypothetical protein  31.77 
 
 		 219 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.707041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0266  hypothetical protein  31.77 
 
 		 219 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3387  hypothetical protein  31.77 
 
 		 219 aa  91.3  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0198  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0212  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1932  exonuclease  32.29 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0193  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118338  hitchhiker  0.00000000330541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1271  hypothetical protein  33.85 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2806  hypothetical protein  33.85 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0877  exonuclease  31.58 
 
 		 192 aa  87.4  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3434  hypothetical protein  32.26 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0222  hypothetical protein  32.37 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95196  normal  0.077639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0119  hypothetical protein  31.44 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0207  hypothetical protein  32.7 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0401  hypothetical protein  32.07 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8604  hypothetical protein  33.8 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4318  hypothetical protein  31.61 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0231  hypothetical protein  32.08 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0220  hypothetical protein  32.08 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2093  exonuclease  28.77 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0157  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  22.54 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.32351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0251  ribonuclease T  29.73 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0427  ribonuclease T  29.73 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  hitchhiker  0.000000000415989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1726  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.26 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02742  ribonuclease T  26.63 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0501  ribonuclease T  27.17 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0728  ribonuclease T  25.93 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1051  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.46 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.925098  hitchhiker  0.00013218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1397  ribonuclease T  26.09 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  27.49 
 
 		 570 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18700  ribonuclease T  26.37 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.145132 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1305  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.56 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.29 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4520  ribonuclease T  25.82 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2458  ribonuclease T  27.96 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1085  ribonuclease T  25.41 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1126  ribonuclease T  25.41 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1619  ribonuclease T  26.37 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3036  ribonuclease T  27.42 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  26.34 
 
 		 1435 aa  42  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3895  ribonuclease T  25.82 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2739  ribonuclease T  26.34 
 
 		 222 aa  41.6  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000161836  hitchhiker  0.000451945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1302  ribonuclease T  31.17 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0637  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.95 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.26 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>