38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3139 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3139  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3467  hypothetical protein  94.24 
 
 		 243 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3269  hypothetical protein  88.16 
 
 		 226 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3269  hypothetical protein  81.28 
 
 		 215 aa  348  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3434  hypothetical protein  85.87 
 
 		 215 aa  339  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0193  hypothetical protein  74.37 
 
 		 219 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118338  hitchhiker  0.00000000330541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3387  hypothetical protein  73.37 
 
 		 219 aa  315  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0284  hypothetical protein  75.65 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0266  hypothetical protein  75.65 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2822  hypothetical protein  75.65 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.707041  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0198  hypothetical protein  74.09 
 
 		 219 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0212  hypothetical protein  74.09 
 
 		 219 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3152  hypothetical protein  73.85 
 
 		 218 aa  307  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0119  hypothetical protein  77.17 
 
 		 204 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3401  hypothetical protein  71.64 
 
 		 218 aa  304  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0989061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2908  hypothetical protein  71.64 
 
 		 218 aa  304  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2968  hypothetical protein  71.64 
 
 		 218 aa  304  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3904  hypothetical protein  71.64 
 
 		 218 aa  304  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3823  hypothetical protein  71.64 
 
 		 218 aa  304  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1633  hypothetical protein  71.64 
 
 		 218 aa  304  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0401  hypothetical protein  73.54 
 
 		 209 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4318  hypothetical protein  73.54 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2806  hypothetical protein  67.42 
 
 		 184 aa  265  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1271  hypothetical protein  67.42 
 
 		 184 aa  265  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1014  hypothetical protein  61.93 
 
 		 186 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1932  exonuclease  58.12 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0877  exonuclease  51.12 
 
 		 192 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2093  exonuclease  36.5 
 
 		 202 aa  92.4  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.77 
 
 		 181 aa  92.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8604  hypothetical protein  44.34 
 
 		 167 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4200  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.59 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1965  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.25 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5807  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.73 
 
 		 172 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.983586  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0220  hypothetical protein  29.61 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0231  hypothetical protein  29.61 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0207  hypothetical protein  28.33 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0222  hypothetical protein  30.6 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95196  normal  0.077639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3679  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0147026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>