38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0119 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0119  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4318  hypothetical protein  86.34 
 
 
209 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0401  hypothetical protein  84.88 
 
 
209 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0193  hypothetical protein  87.06 
 
 
219 aa  359  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118338  hitchhiker  0.00000000330541 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0266  hypothetical protein  84.13 
 
 
219 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2822  hypothetical protein  84.13 
 
 
219 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.707041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0284  hypothetical protein  84.13 
 
 
219 aa  359  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3387  hypothetical protein  84.13 
 
 
219 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0212  hypothetical protein  82.69 
 
 
219 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0198  hypothetical protein  82.69 
 
 
219 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3152  hypothetical protein  83.5 
 
 
218 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2908  hypothetical protein  82.04 
 
 
218 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2968  hypothetical protein  82.04 
 
 
218 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3904  hypothetical protein  82.04 
 
 
218 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3823  hypothetical protein  82.04 
 
 
218 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1633  hypothetical protein  82.04 
 
 
218 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3401  hypothetical protein  82.04 
 
 
218 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0989061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3139  hypothetical protein  77.17 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3467  hypothetical protein  75.96 
 
 
243 aa  304  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3269  hypothetical protein  72.59 
 
 
215 aa  304  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3269  hypothetical protein  75.54 
 
 
226 aa  299  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3434  hypothetical protein  77.27 
 
 
215 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.175686  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2806  hypothetical protein  62.09 
 
 
184 aa  247  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1271  hypothetical protein  62.09 
 
 
184 aa  247  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1014  hypothetical protein  62.5 
 
 
186 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1932  exonuclease  59.46 
 
 
193 aa  228  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0877  exonuclease  53.37 
 
 
192 aa  205  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2093  exonuclease  36.54 
 
 
202 aa  97.8  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8604  hypothetical protein  43.93 
 
 
167 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.44 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4200  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.4 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5807  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.983586  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0231  hypothetical protein  29.44 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0220  hypothetical protein  29.44 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0222  hypothetical protein  31.68 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95196  normal  0.077639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0207  hypothetical protein  32.12 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1965  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.84 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3679  hypothetical protein  35.16 
 
 
107 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0147026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>