56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4200 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4200  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1965  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  60.89 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3679  hypothetical protein  80 
 
 		 107 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0147026 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.2 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0207  hypothetical protein  39.63 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0231  hypothetical protein  39.02 
 
 		 172 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0220  hypothetical protein  39.02 
 
 		 172 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5807  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.67 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.983586  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0222  hypothetical protein  37.21 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95196  normal  0.077639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3269  hypothetical protein  33.5 
 
 		 215 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0877  exonuclease  34.04 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4318  hypothetical protein  32.64 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0401  hypothetical protein  32.64 
 
 		 209 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8604  hypothetical protein  37.76 
 
 		 167 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3434  hypothetical protein  32.96 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0198  hypothetical protein  32.46 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1271  hypothetical protein  31.94 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2806  hypothetical protein  31.94 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3269  hypothetical protein  34.05 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0212  hypothetical protein  32.46 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3139  hypothetical protein  34.59 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2093  exonuclease  30.81 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1014  hypothetical protein  32.04 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2908  hypothetical protein  33.15 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3401  hypothetical protein  33.15 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0989061  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1633  hypothetical protein  33.15 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3823  hypothetical protein  33.15 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3904  hypothetical protein  33.15 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2968  hypothetical protein  33.15 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0119  hypothetical protein  32.4 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0266  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2822  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.707041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0284  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3152  hypothetical protein  32.6 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0193  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118338  hitchhiker  0.00000000330541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1932  exonuclease  33.7 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3467  hypothetical protein  33.51 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3387  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1051  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.33 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.925098  hitchhiker  0.00013218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1726  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.91 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  28.16 
 
 		 1367 aa  48.5  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  28.16 
 
 		 1367 aa  48.5  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.67 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0300  ribonuclease T  27.81 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0088  DNA polymerase III subunit alpha  24.72 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0427  ribonuclease T  24.75 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  hitchhiker  0.000000000415989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0251  ribonuclease T  24.75 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  25.56 
 
 		 1426 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2268  ribonuclease T  26.29 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.862019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0728  ribonuclease T  26.23 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1154  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.97 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.25 
 
 		 328 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0089  exonuclease  26.23 
 
 		 233 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.289343 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1287  ribonuclease T  28.06 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0645  ribonuclease T  24.49 
 
 		 241 aa  41.2  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.677543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00538  ribonuclease T  29.46 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0528077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>