254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1287 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1287  ribonuclease T  100 
 
 		 210 aa  440  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1351  ribonuclease T  99.52 
 
 		 210 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0135397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00538  ribonuclease T  74.52 
 
 		 211 aa  332  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0528077  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1302  ribonuclease T  77.72 
 
 		 194 aa  320  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0728  ribonuclease T  58.33 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1126  ribonuclease T  59.51 
 
 		 224 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1619  ribonuclease T  59.31 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18700  ribonuclease T  59.41 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.145132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1114  ribonuclease T  61.22 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2268  ribonuclease T  58.33 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.862019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1391  ribonuclease T  59.41 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4327  ribonuclease T  57.49 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4520  ribonuclease T  60.71 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1085  ribonuclease T  60.51 
 
 		 203 aa  237  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3895  ribonuclease T  59.69 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4158  ribonuclease T  59.69 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2458  ribonuclease T  60.1 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14060  ribonuclease T  60.51 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1633  ribonuclease T  55.05 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000360038  hitchhiker  0.000696557 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1661  ribonuclease T  56.06 
 
 		 274 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000109903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0350  ribonuclease T  56.35 
 
 		 228 aa  228  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2077  ribonuclease T  55.61 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1866  ribonuclease T  54.55 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00131644  normal  0.0390394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2128  ribonuclease T  57.22 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2429  ribonuclease T  52.71 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.759564  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2894  ribonuclease T  52.31 
 
 		 207 aa  215  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3036  ribonuclease T  51.79 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2506  ribonuclease T  54.92 
 
 		 221 aa  211  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3473  ribonuclease T  53 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0597  ribonuclease T  51.79 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0238382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0300  ribonuclease T  51.58 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0501  ribonuclease T  49.47 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02991  ribonuclease T  49.24 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002938  ribonuclease T  49.49 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000394372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02742  ribonuclease T  47.72 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0645  ribonuclease T  51.58 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.677543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0527  ribonuclease T  49.49 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01622  ribonuclease T  51.04 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0540348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1988  ribonuclease T  51.04 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2364  ribonuclease T  51.04 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1844  ribonuclease T  51.04 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1729  ribonuclease T  51.04 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01612  hypothetical protein  51.04 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0578049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1863  ribonuclease T  51.04 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1977  ribonuclease T  51.04 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170755  hitchhiker  0.00113879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1546  ribonuclease T  51.04 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  0.657229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1862  ribonuclease T  48.98 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.31939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1397  ribonuclease T  48.21 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1531  ribonuclease T  49.25 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  normal  0.241323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1909  ribonuclease T  50 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1759  ribonuclease T  49.48 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523182  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1544  ribonuclease T  50 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1604  ribonuclease T  50 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2568  ribonuclease T  49.48 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1868  ribonuclease T  49.48 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1531  ribonuclease T  50 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1740  ribonuclease T  50 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00194443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2199  ribonuclease T  48.72 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.595371  hitchhiker  0.00000581969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1794  ribonuclease T  50 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109049  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1719  ribonuclease T  48.72 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00130888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1456  ribonuclease T  47.18 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.527776  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0251  ribonuclease T  55.15 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0427  ribonuclease T  55.15 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  hitchhiker  0.000000000415989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2739  ribonuclease T  47.69 
 
 		 222 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000161836  hitchhiker  0.000451945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1850  ribonuclease T  48.21 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000591528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1399  ribonuclease T  46.88 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415119  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0085  ribonuclease T  49.48 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.169544  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2385  ribonuclease T  48.44 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0167921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1520  ribonuclease T  46.67 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0577175  normal  0.681349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2093  ribonuclease T  47.92 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000154544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2669  ribonuclease T  47.69 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1687  ribonuclease T  47.18 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2571  ribonuclease T  47.69 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000796721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2755  ribonuclease T  47.18 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2375  ribonuclease T  46.57 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000351163  normal  0.329752 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2447  ribonuclease T  46.57 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000116461  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2540  ribonuclease T  46.57 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1735  ribonuclease T  46.88 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2545  ribonuclease T  46.88 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000125683  hitchhiker  0.0000000175262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1739  ribonuclease T  46.88 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000763816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1778  ribonuclease T  46.88 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1600  ribonuclease T  46.8 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000738709  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2450  ribonuclease T  45.5 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299626  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  29.61 
 
 		 1440 aa  62  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.96 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  29.12 
 
 		 1444 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.92 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  26.04 
 
 		 1493 aa  52.4  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.26 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  30.77 
 
 		 1635 aa  51.6  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  27.47 
 
 		 1435 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.72 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.66 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.98 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.87 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2000  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000879357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2323  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00003917  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>