38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0266 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0266  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0284  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2822  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.707041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0212  hypothetical protein  98.17 
 
 
219 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0198  hypothetical protein  98.17 
 
 
219 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3387  hypothetical protein  96.8 
 
 
219 aa  440  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0193  hypothetical protein  96.35 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118338  hitchhiker  0.00000000330541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3152  hypothetical protein  88.18 
 
 
218 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3401  hypothetical protein  86.7 
 
 
218 aa  359  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0989061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0401  hypothetical protein  83.02 
 
 
209 aa  359  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1633  hypothetical protein  86.7 
 
 
218 aa  359  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3823  hypothetical protein  86.7 
 
 
218 aa  359  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3904  hypothetical protein  86.7 
 
 
218 aa  359  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2968  hypothetical protein  86.7 
 
 
218 aa  359  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0119  hypothetical protein  84.13 
 
 
204 aa  359  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2908  hypothetical protein  86.7 
 
 
218 aa  359  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4318  hypothetical protein  82.55 
 
 
209 aa  357  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3269  hypothetical protein  76.8 
 
 
215 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3467  hypothetical protein  74.61 
 
 
243 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3139  hypothetical protein  75.65 
 
 
239 aa  313  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3269  hypothetical protein  78.8 
 
 
226 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3434  hypothetical protein  79.1 
 
 
215 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.175686  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2806  hypothetical protein  62.92 
 
 
184 aa  249  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1271  hypothetical protein  62.92 
 
 
184 aa  249  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1932  exonuclease  61.05 
 
 
193 aa  238  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1014  hypothetical protein  60.8 
 
 
186 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0877  exonuclease  50.27 
 
 
192 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2093  exonuclease  39.02 
 
 
202 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.77 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8604  hypothetical protein  44.14 
 
 
167 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4200  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.28 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5807  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.59 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.983586  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1965  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.98 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0220  hypothetical protein  35.04 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0231  hypothetical protein  35.04 
 
 
172 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0222  hypothetical protein  32.7 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95196  normal  0.077639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0207  hypothetical protein  32.85 
 
 
172 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3679  hypothetical protein  35.16 
 
 
107 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0147026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>