108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0157 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0157  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.32351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  29.14 
 
 		 1390 aa  61.6  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1051  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.32 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.925098  hitchhiker  0.00013218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0716  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.700864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0778  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0904  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.46 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1023  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.5 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0966  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.19 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0637  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.5 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.54 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  32.6 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0826  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.5 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.458335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  30.6 
 
 		 719 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  32 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.47 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1726  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.11 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2128  ribonuclease T  34.75 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.08 
 
 		 241 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.71 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.24 
 
 		 706 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  23.3 
 
 		 1367 aa  48.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  23.3 
 
 		 1367 aa  48.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.07 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.86 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.02 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.9 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.9 
 
 		 481 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.81 
 
 		 378 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.43 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  29.94 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.58 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.52 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.01 
 
 		 375 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0350  ribonuclease T  36.61 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2255  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.06 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.33 
 
 		 659 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.94 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.29 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  29.14 
 
 		 1426 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2458  ribonuclease T  31.82 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.9 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  29.28 
 
 		 244 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  32.6 
 
 		 240 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2429  ribonuclease T  29.29 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.759564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.09 
 
 		 236 aa  44.7  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.14 
 
 		 235 aa  44.7  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1739  ribonuclease T  27.13 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000763816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2545  ribonuclease T  27.13 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000125683  hitchhiker  0.0000000175262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  32 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.43 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  28.16 
 
 		 1449 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2375  ribonuclease T  27.13 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000351163  normal  0.329752 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2447  ribonuclease T  27.13 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000116461  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  29.28 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.18 
 
 		 595 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2540  ribonuclease T  27.13 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.14 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.29 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.07 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  28.25 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.73 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1735  ribonuclease T  27.13 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  26.7 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1778  ribonuclease T  27.13 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 		 398 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.29 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  28.16 
 
 		 1449 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.86 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.68 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.41 
 
 		 719 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.68 
 
 		 715 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2755  ribonuclease T  27.13 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.99 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.9 
 
 		 375 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0528  exonuclease  26.82 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00892328  normal  0.16034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  25.42 
 
 		 247 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2465  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3393  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.46 
 
 		 246 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  28.89 
 
 		 253 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  30.34 
 
 		 229 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  28.89 
 
 		 253 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  28.89 
 
 		 253 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  28.89 
 
 		 253 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  28.89 
 
 		 253 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3450  DNA polymerase III subunit epsilon  26.46 
 
 		 246 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.258177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0229  DNA polymerase III subunit epsilon  26.46 
 
 		 246 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0164844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  25 
 
 		 1402 aa  42  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00208  DNA polymerase III subunit epsilon  26.52 
 
 		 243 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  28.89 
 
 		 240 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  28.89 
 
 		 240 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0218  DNA polymerase III subunit epsilon  26.52 
 
 		 243 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00177967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0221  DNA polymerase III subunit epsilon  26.52 
 
 		 243 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0211  DNA polymerase III subunit epsilon  26.52 
 
 		 243 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  37.61 
 
 		 578 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00213  hypothetical protein  26.52 
 
 		 243 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>