More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0904 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0904  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 180 aa  357  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1023  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  98.88 
 
 		 180 aa  352  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.156305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0826  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  97.22 
 
 		 180 aa  347  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.458335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0778  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  97.78 
 
 		 180 aa  347  6e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0637  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  96.67 
 
 		 180 aa  347  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0716  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  97.77 
 
 		 180 aa  346  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.700864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0966  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  93.33 
 
 		 180 aa  335  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  31.64 
 
 		 1367 aa  68.6  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  29.24 
 
 		 1390 aa  68.6  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  35.8 
 
 		 695 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  31.64 
 
 		 1367 aa  68.6  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.23 
 
 		 695 aa  67.8  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.66 
 
 		 695 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0978  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.65 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0235504  normal  0.0652516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.75 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  29.76 
 
 		 315 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.82 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2832  DNA polymerase III subunit epsilon  26.14 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1501  DNA-directed DNA polymerase  31.69 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0237591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.03 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1726  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.03 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  29.19 
 
 		 1397 aa  61.6  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  29.17 
 
 		 315 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  29.17 
 
 		 315 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  29.17 
 
 		 315 aa  61.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  29.17 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  29.17 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  29.17 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003140  DNA polymerase III epsilon subunit  33.66 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.5 
 
 		 719 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  32.53 
 
 		 603 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.57 
 
 		 405 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.3 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00168  DNA polymerase III subunit epsilon  25.56 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 		 921 aa  58.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  31.76 
 
 		 611 aa  58.2  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  28.24 
 
 		 1402 aa  57.8  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0350  ribonuclease T  33.58 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 378 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.86 
 
 		 463 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  29.03 
 
 		 1479 aa  57.4  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0157  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  38.46 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.32351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.54 
 
 		 406 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.39 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.87 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  30.99 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  32.95 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  34.4 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.4 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  32.69 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  32.69 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  32.69 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.79 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.92 
 
 		 475 aa  55.5  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  28.24 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  29.25 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5959  DNA polymerase III subunit epsilon  31.29 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.37 
 
 		 659 aa  55.1  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2682  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0437  DNA polymerase III subunit epsilon  28.83 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.37 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.33 
 
 		 927 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  29.01 
 
 		 1493 aa  54.3  0.0000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2137  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.81 
 
 		 864 aa  54.3  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002200  DNA polymerase III epsilon subunit  26.11 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.56 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0251  exonuclease  29.27 
 
 		 256 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.71 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.54 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.88 
 
 		 1442 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.1 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  31.17 
 
 		 333 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 236 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.73 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0528  exonuclease  27.37 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00892328  normal  0.16034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.55 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.73 
 
 		 547 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0603  DNA polymerase III subunit epsilon  28.1 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.27 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.03 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  30.77 
 
 		 578 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  30.91 
 
 		 244 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  32 
 
 		 238 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 		 245 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  31.13 
 
 		 245 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0391  DNA polymerase III subunit epsilon  31.63 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0160447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  26.35 
 
 		 1433 aa  52  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.48 
 
 		 375 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  27.98 
 
 		 299 aa  52  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.73 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  29.87 
 
 		 345 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.91 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.11 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>