260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1633 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
367 aa  762    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1655  DNA polymerase III subunit epsilon  42.94 
 
 
302 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1394  DNA polymerase III subunit epsilon  42.94 
 
 
302 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00500752  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1294  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  40.65 
 
 
177 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2310  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.03 
 
 
336 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0325  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.26 
 
 
297 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1982  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.44 
 
 
184 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0401  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.88 
 
 
297 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1948  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.44 
 
 
184 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1688  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.63 
 
 
186 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0402  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.5 
 
 
179 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000167602  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0370  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.65 
 
 
297 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2432  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.77 
 
 
164 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000167398  hitchhiker  0.000000855103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2578  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.11 
 
 
337 aa  99.8  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0358543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1432  exonuclease  32.74 
 
 
184 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0141  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.78 
 
 
177 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000727822  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1529  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  39.13 
 
 
177 aa  96.7  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
210 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.22 
 
 
183 aa  92.8  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.25 
 
 
289 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3096  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.97 
 
 
201 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.316534  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0492  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.85 
 
 
189 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2865  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3-5 exonuclease  34.34 
 
 
207 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3293  exonuclease  34.67 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413977  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1746  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.95 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0595  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.84 
 
 
170 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.837923  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1663  DNA polymerase III, epsilon subunit or related 3'-5' exonuclease  32.3 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2577  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.61 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181188  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08390  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  33.33 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3865  hypothetical protein  26.82 
 
 
201 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.62314 
 
 
-
 
NC_002950  PG0223  exonuclease  31.29 
 
 
163 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2129  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2838  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.04 
 
 
199 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  hitchhiker  0.0093058 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3538  transposase  31.21 
 
 
282 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.761047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  32.3 
 
 
1433 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0132  exonuclease  32.26 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294449  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  33.54 
 
 
232 aa  68.9  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.02 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  32.3 
 
 
1442 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4113  hypothetical protein  25.7 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  decreased coverage  0.00587684 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0663  NAD-dependent DNA ligase  24.4 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000015383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.53 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  34.34 
 
 
1402 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2759  DNA polymerase III subunit epsilon  30.73 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.137424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.38 
 
 
224 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.96 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4454  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.75 
 
 
187 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000618173 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  29.76 
 
 
1465 aa  64.3  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2393  NAD-dependent DNA ligase  22.09 
 
 
216 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  29.82 
 
 
1390 aa  63.5  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  26.09 
 
 
516 aa  63.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
186 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
186 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  29.56 
 
 
1407 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  31.68 
 
 
1527 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.32 
 
 
174 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2481  DNA polymerase III subunit epsilon  29.61 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000473559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  32.24 
 
 
1367 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  32.24 
 
 
1367 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.62 
 
 
498 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  32.12 
 
 
1362 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.18 
 
 
449 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 
315 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  32.12 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.26 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  27.27 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  32.03 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  32.7 
 
 
315 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  30.9 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  32.7 
 
 
315 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  29.89 
 
 
299 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  29.87 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 
315 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 
315 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 
315 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 
315 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.27 
 
 
410 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.82 
 
 
719 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.82 
 
 
204 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  31.68 
 
 
720 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1827  NAD-dependent DNA ligase  26.79 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0330  exonuclease  29.34 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  29.17 
 
 
1447 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.44 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.64 
 
 
610 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  31.1 
 
 
1449 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  31.1 
 
 
1449 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.75 
 
 
237 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.01 
 
 
954 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  27.59 
 
 
645 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  31.14 
 
 
719 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.3 
 
 
715 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.01 
 
 
476 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.88 
 
 
226 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.67 
 
 
590 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.3 
 
 
234 aa  53.5  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 
459 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>