12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4113 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4113  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  decreased coverage  0.00587684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3865  hypothetical protein  36.5 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.62314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2393  NAD-dependent DNA ligase  34.67 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0663  NAD-dependent DNA ligase  36.46 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000015383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2687  NAD-dependent DNA ligase  30.48 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835433 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1077  NAD-dependent DNA ligase  32.11 
 
 		 301 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2589  NAD-dependent DNA ligase  30.48 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3053  BRCT domain protein  29.84 
 
 		 298 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0862  hypothetical protein  32.37 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.253306  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.93 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1827  NAD-dependent DNA ligase  23.68 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  29.8 
 
 		 2123 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>