23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1827 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1827  NAD-dependent DNA ligase  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3865  hypothetical protein  31.77 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.62314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2393  NAD-dependent DNA ligase  32.64 
 
 		 216 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3053  BRCT domain protein  26.89 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0663  NAD-dependent DNA ligase  26.01 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000015383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2687  NAD-dependent DNA ligase  26.64 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2589  NAD-dependent DNA ligase  26.2 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1077  NAD-dependent DNA ligase  27.42 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4113  hypothetical protein  22.81 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  decreased coverage  0.00587684 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  19.71 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0862  hypothetical protein  24.72 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.253306  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1066  DNA ligase, NAD-dependent  31.46 
 
 		 709 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  34.15 
 
 		 681 aa  47  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  30.34 
 
 		 671 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 442 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  26.25 
 
 		 672 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  29.25 
 
 		 668 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  30.38 
 
 		 676 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1084  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 700 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.419808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  28.41 
 
 		 670 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  40 
 
 		 668 aa  42  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  30.59 
 
 		 671 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  30 
 
 		 696 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>