More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1663 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1663  DNA polymerase III, epsilon subunit or related 3'-5' exonuclease  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1529  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  58.29 
 
 
177 aa  209  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0402  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  49.72 
 
 
179 aa  191  7e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000167602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1294  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  45.2 
 
 
177 aa  168  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1394  DNA polymerase III subunit epsilon  42.5 
 
 
302 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00500752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1655  DNA polymerase III subunit epsilon  42.5 
 
 
302 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.52 
 
 
183 aa  120  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2129  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.16 
 
 
335 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0223  exonuclease  38.1 
 
 
163 aa  108  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1688  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.93 
 
 
186 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2865  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3-5 exonuclease  33.52 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0401  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.82 
 
 
297 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3096  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.89 
 
 
201 aa  97.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.316534  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0370  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.2 
 
 
297 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1432  exonuclease  33.33 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.7 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0141  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.42 
 
 
177 aa  95.5  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000727822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0325  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.64 
 
 
297 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2310  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.57 
 
 
336 aa  95.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0492  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.53 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2432  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.74 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000167398  hitchhiker  0.000000855103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.71 
 
 
289 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1948  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.55 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2578  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 
337 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0358543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1982  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.55 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3293  exonuclease  34.62 
 
 
314 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413977  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2577  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.82 
 
 
196 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181188  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0132  exonuclease  31.93 
 
 
196 aa  85.1  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294449  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  31.28 
 
 
1433 aa  84.3  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  32.14 
 
 
1449 aa  84.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.38 
 
 
769 aa  84.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  31.45 
 
 
1397 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.81 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2838  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.29 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  hitchhiker  0.0093058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  30.68 
 
 
1407 aa  82.4  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4454  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.13 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000618173 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  31.55 
 
 
1449 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  28.65 
 
 
1442 aa  82  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 
930 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.3 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  30.91 
 
 
1367 aa  78.2  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  30.91 
 
 
1367 aa  78.2  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1746  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.18 
 
 
280 aa  77.8  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  29.94 
 
 
489 aa  77.4  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  30.2 
 
 
791 aa  77  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  27.71 
 
 
1402 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  26.59 
 
 
1426 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.88 
 
 
565 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 
315 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  30.28 
 
 
1433 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  30.46 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0595  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.22 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.837923  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  29.71 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  29.61 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.81 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  30 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.7 
 
 
462 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  30.82 
 
 
299 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  27.61 
 
 
1440 aa  70.9  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.63 
 
 
406 aa  70.9  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08390  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  30.86 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  27.97 
 
 
970 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.86 
 
 
944 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  27.97 
 
 
1433 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  27.97 
 
 
1433 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  27.97 
 
 
1433 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  27.97 
 
 
1433 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  30 
 
 
1365 aa  70.5  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  27.97 
 
 
1433 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  27.97 
 
 
1433 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  32.34 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  32.34 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  27.97 
 
 
1433 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  28.67 
 
 
1433 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  31.74 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  28.67 
 
 
1433 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.22 
 
 
481 aa  68.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  31.48 
 
 
720 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.5 
 
 
956 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  29.41 
 
 
1444 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.42 
 
 
463 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  28.75 
 
 
315 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  28.75 
 
 
315 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  28.75 
 
 
315 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.71 
 
 
921 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  25.45 
 
 
1432 aa  67.8  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.88 
 
 
921 aa  67.4  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  28.4 
 
 
1435 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3538  transposase  28.82 
 
 
282 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.761047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  28.24 
 
 
584 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.85 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0524  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.33 
 
 
835 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00517102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.85 
 
 
456 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.6 
 
 
442 aa  65.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  31.41 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.61 
 
 
595 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  26.19 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  25.15 
 
 
902 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>