More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1529 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1529  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0402  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  56.9 
 
 
179 aa  215  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000167602  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1663  DNA polymerase III, epsilon subunit or related 3'-5' exonuclease  58.29 
 
 
177 aa  209  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1294  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  48 
 
 
177 aa  174  6e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1655  DNA polymerase III subunit epsilon  46.25 
 
 
302 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1394  DNA polymerase III subunit epsilon  46.25 
 
 
302 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00500752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.26 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0223  exonuclease  40.82 
 
 
163 aa  124  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0401  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.48 
 
 
297 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1688  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.41 
 
 
186 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0492  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.82 
 
 
189 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2865  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3-5 exonuclease  39.41 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0325  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.29 
 
 
297 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2432  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.77 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000167398  hitchhiker  0.000000855103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0370  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.69 
 
 
297 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.12 
 
 
289 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0141  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.97 
 
 
177 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000727822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2129  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.79 
 
 
335 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2577  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.42 
 
 
196 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181188  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3096  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.13 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.316534  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.85 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2838  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.24 
 
 
199 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  hitchhiker  0.0093058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3293  exonuclease  36.94 
 
 
314 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413977  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.47 
 
 
210 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1432  exonuclease  34.66 
 
 
184 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0595  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.39 
 
 
170 aa  101  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.837923  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2578  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.12 
 
 
337 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0358543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  36.02 
 
 
1397 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.13 
 
 
367 aa  96.7  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2310  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.53 
 
 
336 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  32.5 
 
 
1407 aa  95.5  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  33.74 
 
 
1433 aa  95.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  33.54 
 
 
1442 aa  94.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  35.33 
 
 
299 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0132  exonuclease  30.43 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294449  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 
315 aa  92  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  36.54 
 
 
1426 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1948  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.9 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1982  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.9 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 
315 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 
315 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  34.71 
 
 
315 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
930 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 
315 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 
315 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  34.59 
 
 
315 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  30.82 
 
 
1433 aa  87.8  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 
449 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  33.96 
 
 
315 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  33.96 
 
 
315 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  33.96 
 
 
315 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08390  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  33.95 
 
 
381 aa  85.5  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.07 
 
 
595 aa  84.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  35 
 
 
769 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  29.38 
 
 
1433 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  28.75 
 
 
1433 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  28.75 
 
 
1433 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  32.08 
 
 
1402 aa  81.3  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  31.25 
 
 
1444 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  32.52 
 
 
1449 aa  80.9  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  28.12 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  28.12 
 
 
970 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  28.12 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  28.12 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  28.12 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  28.12 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  28.12 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  30 
 
 
1440 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  32.3 
 
 
1449 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4454  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.45 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000618173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.63 
 
 
442 aa  77  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  29.55 
 
 
1447 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  28.75 
 
 
1435 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.92 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.19 
 
 
921 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  29.63 
 
 
1367 aa  75.1  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  29.63 
 
 
1367 aa  75.1  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  27.5 
 
 
791 aa  74.7  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  30.25 
 
 
584 aa  73.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  31.48 
 
 
616 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1746  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.63 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3538  transposase  32.39 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.761047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0330  exonuclease  29.34 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  27.22 
 
 
1464 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  31.4 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.25 
 
 
715 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.63 
 
 
453 aa  72  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.92 
 
 
721 aa  72  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  30.86 
 
 
570 aa  71.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.08 
 
 
547 aa  71.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  31.48 
 
 
601 aa  71.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  31.87 
 
 
345 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.65 
 
 
462 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  29.45 
 
 
551 aa  71.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.93 
 
 
695 aa  71.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 
934 aa  70.9  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  26.42 
 
 
489 aa  70.9  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  30.25 
 
 
578 aa  70.9  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  30 
 
 
720 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>