More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2432 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2432  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
164 aa  341  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000167398  hitchhiker  0.000000855103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0141  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.52 
 
 
177 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000727822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.45 
 
 
176 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2578  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  45.91 
 
 
337 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0358543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1394  DNA polymerase III subunit epsilon  43.56 
 
 
302 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00500752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1655  DNA polymerase III subunit epsilon  43.56 
 
 
302 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2310  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.28 
 
 
336 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1688  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.25 
 
 
186 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3096  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45 
 
 
201 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.316534  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0401  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.64 
 
 
297 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1529  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  41.77 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0325  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.1 
 
 
297 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.22 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0370  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.94 
 
 
297 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0492  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.88 
 
 
189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6637  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1948  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40.38 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1982  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.38 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.1 
 
 
289 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2129  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.43 
 
 
335 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2865  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3-5 exonuclease  40.12 
 
 
207 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161368  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0402  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  39.63 
 
 
179 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000167602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08390  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  41.78 
 
 
381 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.59 
 
 
183 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1294  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  40.12 
 
 
177 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0223  exonuclease  40.14 
 
 
163 aa  102  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1432  exonuclease  38.22 
 
 
184 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.77 
 
 
367 aa  99.8  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3293  exonuclease  39.22 
 
 
314 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413977  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2577  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.75 
 
 
196 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181188  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1663  DNA polymerase III, epsilon subunit or related 3'-5' exonuclease  37.74 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2838  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.06 
 
 
199 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  hitchhiker  0.0093058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0595  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.06 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.837923  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1746  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.04 
 
 
280 aa  87.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4454  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.62 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000618173 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3538  transposase  34.15 
 
 
282 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.761047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0132  exonuclease  31.06 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294449  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0330  exonuclease  31.01 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  32.5 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  32.5 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  32.5 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  32.5 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  32.5 
 
 
315 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  31.87 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  32.92 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  31.87 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  31.87 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.25 
 
 
565 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.08 
 
 
406 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  32.3 
 
 
315 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  31.01 
 
 
345 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.67 
 
 
909 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.06 
 
 
405 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  31.9 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  30.38 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  31.9 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  31.9 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  31.74 
 
 
1402 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.1 
 
 
610 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  32.5 
 
 
574 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  26.14 
 
 
267 aa  64.3  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  25.81 
 
 
273 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.01 
 
 
234 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3952  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.52 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  34.38 
 
 
242 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  29.09 
 
 
489 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  28.57 
 
 
570 aa  62.4  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.32 
 
 
218 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  30.63 
 
 
299 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  31.68 
 
 
574 aa  61.6  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.95 
 
 
228 aa  60.8  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  32.53 
 
 
1442 aa  61.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  31.1 
 
 
603 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  29.52 
 
 
578 aa  60.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.36 
 
 
293 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  28.4 
 
 
231 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  31.71 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0863  DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 
265 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  30.49 
 
 
1440 aa  58.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4078  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.77 
 
 
197 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0768  DNA polymerase III subunit epsilon  24.84 
 
 
262 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  27.81 
 
 
204 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.11 
 
 
237 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  31.65 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.38 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  26.54 
 
 
242 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.22 
 
 
595 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  32.28 
 
 
222 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.4 
 
 
769 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.91 
 
 
921 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.29 
 
 
609 aa  55.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  29.09 
 
 
791 aa  55.1  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2415  exodeoxyribonuclease X  33.12 
 
 
220 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  33.8 
 
 
954 aa  54.7  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  30.49 
 
 
601 aa  54.3  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  25.6 
 
 
242 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 
236 aa  54.3  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.3 
 
 
952 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  25.6 
 
 
242 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.56 
 
 
547 aa  53.9  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  27.54 
 
 
203 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>