288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1746 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1746  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2578  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40.7 
 
 		 337 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0358543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1655  DNA polymerase III subunit epsilon  40 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1394  DNA polymerase III subunit epsilon  38.15 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00500752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2310  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.77 
 
 		 336 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0325  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.09 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08390  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  44.9 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69329  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1432  exonuclease  36.31 
 
 		 184 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0370  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1688  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.1 
 
 		 186 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3293  exonuclease  39.18 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3096  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.87 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.316534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0492  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.1 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.6637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0401  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.12 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1982  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.94 
 
 		 184 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1948  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.94 
 
 		 184 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.53 
 
 		 183 aa  105  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4454  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.38 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000618173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.95 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2577  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.42 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2432  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.04 
 
 		 164 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000167398  hitchhiker  0.000000855103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0595  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.09 
 
 		 170 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.837923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2129  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.19 
 
 		 335 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2865  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3-5 exonuclease  35.85 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0141  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.04 
 
 		 177 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000727822  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0223  exonuclease  39.04 
 
 		 163 aa  96.3  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.19 
 
 		 210 aa  96.3  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2838  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.06 
 
 		 199 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  hitchhiker  0.0093058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1294  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  31.41 
 
 		 177 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.95 
 
 		 367 aa  90.5  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3538  transposase  34.32 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.761047 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1663  DNA polymerase III, epsilon subunit or related 3'-5' exonuclease  31.18 
 
 		 177 aa  86.7  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0402  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.72 
 
 		 179 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000167602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1529  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  29.63 
 
 		 177 aa  84.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0132  exonuclease  32.92 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.73 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0330  exonuclease  29.41 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4078  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.52 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  29.63 
 
 		 1367 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  29.63 
 
 		 1367 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.39 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  31.36 
 
 		 1433 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  26.92 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  26.92 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  26.92 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  26.92 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  26.67 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  26.92 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  24.48 
 
 		 1390 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  26.88 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  26.99 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  26.99 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  33.9 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  33.9 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  33.9 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  29.29 
 
 		 570 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  28.74 
 
 		 1442 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  26.38 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.15 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  26.09 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.76 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  27.7 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  26.88 
 
 		 1397 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  34.82 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.44 
 
 		 610 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  28.95 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.45 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.47 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002773  DNA polymerase III epsilon subunit  26.39 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  27.14 
 
 		 578 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  32.31 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.18 
 
 		 498 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  29.49 
 
 		 601 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  29.32 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  34.82 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  32.31 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02468  DNA polymerase III subunit epsilon  32.5 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.650155  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  32.31 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  29.32 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  29.81 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  28.97 
 
 		 630 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  30.99 
 
 		 168 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  28.97 
 
 		 630 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  26.22 
 
 		 791 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  28.97 
 
 		 630 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  29.91 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  26.14 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.53 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.53 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03210  DNA polymerase III subunit epsilon  27.27 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  33.93 
 
 		 242 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  29.31 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.76 
 
 		 406 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.18 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  27.94 
 
 		 603 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  30 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  23.58 
 
 		 489 aa  51.6  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  27.5 
 
 		 1440 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>