271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2763 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  53.21 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  52.86 
 
 
312 aa  290  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  51.07 
 
 
283 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  48.58 
 
 
284 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  48.23 
 
 
284 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  48.23 
 
 
284 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  49.64 
 
 
284 aa  262  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  45.36 
 
 
283 aa  259  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 
285 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  45.91 
 
 
283 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  49.3 
 
 
284 aa  254  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  44.68 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  45.55 
 
 
287 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  45.55 
 
 
287 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  45.55 
 
 
287 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  43.06 
 
 
281 aa  248  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  43.42 
 
 
284 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  43.32 
 
 
284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  47.69 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  48.4 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  42.35 
 
 
281 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  41.7 
 
 
288 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  40.99 
 
 
288 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  40.71 
 
 
281 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  39.64 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  41.99 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  41.34 
 
 
281 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  35.56 
 
 
287 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  36.4 
 
 
286 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  28.03 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  28.57 
 
 
284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  27.87 
 
 
284 aa  125  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  25.71 
 
 
278 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  25.69 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  44.35 
 
 
126 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  19.5 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.69 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  36.91 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  28.22 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  28.22 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  28.65 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  29.13 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  28.66 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  29.88 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  25 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  32.43 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  27.5 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  25.22 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  25.22 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  31.68 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  29.15 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  25.22 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  33.09 
 
 
277 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  29.79 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  27.31 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  31.25 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.1 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  20.55 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  31.58 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  26.04 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  25.68 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  27.5 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  27.66 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  27.03 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  28.57 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  29.63 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  26.87 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  30.63 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  27.73 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  27.12 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  25 
 
 
151 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  27.07 
 
 
284 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.87 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  26.73 
 
 
283 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  29.57 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  23.76 
 
 
275 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  30.2 
 
 
286 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  32.67 
 
 
280 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  28.37 
 
 
311 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  23.79 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 
271 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  25.94 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  27.97 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  27.38 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  26.63 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  28.09 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  27.01 
 
 
281 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  27.52 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  23.2 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>