277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1750 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1750  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 341 aa  195  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4672  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 341 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  32.15 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  37.11 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2086  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701877 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  25.94 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  25.59 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1715  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 230 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  42.42 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  42.03 
 
 		 187 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 221 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  35.44 
 
 		 229 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2477  transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 		 214 aa  49.7  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 229 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 229 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 219 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  41.82 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3471  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  41.27 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  36.92 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2845  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  25.76 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  21.13 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 229 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  27.51 
 
 		 230 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 228 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 228 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 226 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2521  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 217 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2566  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 217 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.520739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>