More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2845 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2845  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  39.62 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 227 aa  104  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 230 aa  98.2  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.25 
 
 		 237 aa  95.5  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 244 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 231 aa  91.3  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 224 aa  91.3  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  39.29 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 262 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  34.34 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 230 aa  88.2  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  31.16 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 238 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 262 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 242 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 247 aa  85.1  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>