More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1518 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1518  NAD-dependent DNA ligase LigB  100 
 
 		 629 aa  1259    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000466124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0498  NAD-dependent DNA ligase LigB  44.64 
 
 		 567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4968  NAD-dependent DNA ligase LigB  45.76 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4796  NAD-dependent DNA ligase LigB  44.38 
 
 		 561 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4841  NAD-dependent DNA ligase LigB  46.24 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0453  NAD-dependent DNA ligase LigB  46.81 
 
 		 562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0382  DNA ligase, NAD-dependent, putative  42.75 
 
 		 561 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5270  NAD-dependent DNA ligase LigB  44.91 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.27312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5017  NAD-dependent DNA ligase LigB  44.88 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4208  NAD-dependent DNA ligase LigB  41.03 
 
 		 562 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03590  NAD-dependent DNA ligase LigB  46.74 
 
 		 560 aa  419  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3947  NAD-dependent DNA ligase LigB  42.26 
 
 		 575 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4144  NAD-dependent DNA ligase LigB  41.53 
 
 		 560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.610084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4491  NAD-dependent DNA ligase LigB  41.05 
 
 		 563 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5017  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.14 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0058  DNA ligase (NAD(+))  38.69 
 
 		 560 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0092  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.59 
 
 		 556 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4148  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.67 
 
 		 562 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.969555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3858  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.31 
 
 		 562 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0064  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.31 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199825  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03504  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.31 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3981  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.27 
 
 		 560 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4175  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.54 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0042  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.31 
 
 		 567 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03456  hypothetical protein  39.31 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0046  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.54 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3956  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.86 
 
 		 561 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4019  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.67 
 
 		 561 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3947  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.85 
 
 		 561 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109468 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4065  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.59 
 
 		 561 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4126  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.59 
 
 		 561 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  25.95 
 
 		 681 aa  181  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  26.67 
 
 		 680 aa  177  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  25.26 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  29.02 
 
 		 692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  27.23 
 
 		 673 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  29.72 
 
 		 673 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  27.15 
 
 		 673 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  25.04 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  28.67 
 
 		 699 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4463  DNA ligase, NAD-dependent  28.95 
 
 		 693 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0518609  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  27.72 
 
 		 668 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  26.47 
 
 		 688 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  26.47 
 
 		 688 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  27.71 
 
 		 680 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  27.29 
 
 		 690 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  25.4 
 
 		 668 aa  165  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  25.95 
 
 		 680 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  28.47 
 
 		 694 aa  163  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  28.89 
 
 		 681 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  29.72 
 
 		 703 aa  163  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  27.11 
 
 		 690 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  28.27 
 
 		 671 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  26.78 
 
 		 668 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  28.27 
 
 		 671 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  27.29 
 
 		 691 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0702  NAD-dependent DNA ligase  25.52 
 
 		 677 aa  161  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  25.38 
 
 		 670 aa  161  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  26.48 
 
 		 673 aa  160  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  26.23 
 
 		 685 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  23.92 
 
 		 684 aa  160  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  26.23 
 
 		 685 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  26.23 
 
 		 685 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  27.22 
 
 		 685 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  29.89 
 
 		 711 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  23.67 
 
 		 675 aa  158  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  27.32 
 
 		 668 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  29.84 
 
 		 664 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  26.58 
 
 		 689 aa  157  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.35 
 
 		 652 aa  157  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  26.92 
 
 		 675 aa  157  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  27.51 
 
 		 700 aa  157  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0301  DNA ligase, NAD-dependent  24.87 
 
 		 676 aa  157  8e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.10932  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  27.75 
 
 		 680 aa  156  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  26.98 
 
 		 678 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  27.85 
 
 		 667 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  28.07 
 
 		 697 aa  153  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  28.07 
 
 		 683 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  28.98 
 
 		 712 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.65 
 
 		 680 aa  152  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  27.02 
 
 		 669 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  27.76 
 
 		 707 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  29.35 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  26.68 
 
 		 670 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  27.22 
 
 		 677 aa  151  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  24.58 
 
 		 665 aa  151  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  25.31 
 
 		 672 aa  151  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  27.9 
 
 		 673 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0136  DNA ligase, NAD-dependent  24.42 
 
 		 673 aa  150  5e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.145225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  27.65 
 
 		 682 aa  150  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  28.21 
 
 		 690 aa  150  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.93 
 
 		 776 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  28.19 
 
 		 693 aa  150  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.37 
 
 		 669 aa  150  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  27.53 
 
 		 676 aa  150  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0423  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.99 
 
 		 660 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.57 
 
 		 693 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  27 
 
 		 706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2083  DNA ligase, NAD-dependent  33.67 
 
 		 731 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0521924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  28.09 
 
 		 675 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>