More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0092 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03504  NAD-dependent DNA ligase LigB  59.45 
 
 		 560 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0058  DNA ligase (NAD(+))  59.67 
 
 		 560 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3947  NAD-dependent DNA ligase LigB  56.73 
 
 		 561 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3858  NAD-dependent DNA ligase LigB  59.45 
 
 		 562 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3956  NAD-dependent DNA ligase LigB  56.19 
 
 		 561 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03456  hypothetical protein  59.45 
 
 		 560 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0064  NAD-dependent DNA ligase LigB  59.45 
 
 		 560 aa  696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199825  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5017  NAD-dependent DNA ligase LigB  59.64 
 
 		 577 aa  697    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3981  NAD-dependent DNA ligase LigB  59.27 
 
 		 560 aa  696    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4126  NAD-dependent DNA ligase LigB  56.37 
 
 		 561 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4065  NAD-dependent DNA ligase LigB  56.37 
 
 		 561 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4148  NAD-dependent DNA ligase LigB  59.82 
 
 		 562 aa  699    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.969555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0092  NAD-dependent DNA ligase LigB  100 
 
 		 556 aa  1141    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4019  NAD-dependent DNA ligase LigB  56.01 
 
 		 561 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4491  NAD-dependent DNA ligase LigB  46.1 
 
 		 563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4144  NAD-dependent DNA ligase LigB  45.34 
 
 		 560 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.610084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3947  NAD-dependent DNA ligase LigB  44.44 
 
 		 575 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4208  NAD-dependent DNA ligase LigB  45.07 
 
 		 562 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5270  NAD-dependent DNA ligase LigB  42.3 
 
 		 558 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.27312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4175  NAD-dependent DNA ligase LigB  42.21 
 
 		 567 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0042  NAD-dependent DNA ligase LigB  42.13 
 
 		 567 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0046  NAD-dependent DNA ligase LigB  42.13 
 
 		 558 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0498  NAD-dependent DNA ligase LigB  42.14 
 
 		 567 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0453  NAD-dependent DNA ligase LigB  41.96 
 
 		 562 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0382  DNA ligase, NAD-dependent, putative  41.67 
 
 		 561 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4968  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.15 
 
 		 566 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4841  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.48 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4796  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.89 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5017  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.11 
 
 		 566 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03590  NAD-dependent DNA ligase LigB  39.12 
 
 		 560 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1518  NAD-dependent DNA ligase LigB  38.59 
 
 		 629 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000466124  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  26.51 
 
 		 681 aa  161  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  26.2 
 
 		 680 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  24.57 
 
 		 684 aa  155  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0673  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.64 
 
 		 651 aa  153  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0689  NAD-dependent DNA ligase LigA  25 
 
 		 647 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  24.87 
 
 		 680 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1083  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.03 
 
 		 647 aa  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.88186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0614  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.14 
 
 		 647 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  22.63 
 
 		 670 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0483  DNA ligase, NAD-dependent  24.7 
 
 		 674 aa  148  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  24.83 
 
 		 668 aa  147  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1371  DNA ligase, NAD-dependent  25.91 
 
 		 648 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00123694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  25.57 
 
 		 667 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  26.05 
 
 		 675 aa  144  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  25.39 
 
 		 688 aa  143  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  25.39 
 
 		 688 aa  143  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1227  DNA ligase, NAD-dependent  25.65 
 
 		 656 aa  143  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  24.39 
 
 		 667 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  24.39 
 
 		 667 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  23.67 
 
 		 668 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  25.81 
 
 		 677 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  26.1 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  24.66 
 
 		 680 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  24.65 
 
 		 673 aa  139  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  25.87 
 
 		 681 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  23.85 
 
 		 665 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  25 
 
 		 675 aa  137  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  24.16 
 
 		 699 aa  136  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1480  DNA ligase, NAD-dependent  24.03 
 
 		 663 aa  136  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.05 
 
 		 652 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  25.18 
 
 		 673 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  24.83 
 
 		 662 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  24.18 
 
 		 670 aa  134  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2023  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.54 
 
 		 647 aa  134  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000845936  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  25.25 
 
 		 668 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  22.77 
 
 		 662 aa  133  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0473  DNA ligase, NAD-dependent  25.97 
 
 		 686 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  24.27 
 
 		 663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0423  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.2 
 
 		 660 aa  131  3e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0562  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.76 
 
 		 660 aa  131  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0449275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  25.09 
 
 		 690 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5111  DNA ligase, NAD-dependent  23.99 
 
 		 695 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246917  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  25.26 
 
 		 690 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  26.85 
 
 		 671 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  26.85 
 
 		 671 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1565  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.72 
 
 		 654 aa  128  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0182697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  25.13 
 
 		 685 aa  128  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  25.43 
 
 		 685 aa  128  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  25.43 
 
 		 666 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  24.87 
 
 		 664 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.98 
 
 		 669 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3294  DNA ligase, NAD-dependent  27.16 
 
 		 795 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.22 
 
 		 670 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.53 
 
 		 670 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.98 
 
 		 669 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  25.83 
 
 		 714 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  24.26 
 
 		 664 aa  126  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  25.9 
 
 		 682 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  22.74 
 
 		 692 aa  126  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  25.18 
 
 		 715 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  25.62 
 
 		 697 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1926  hypothetical protein  22.18 
 
 		 671 aa  126  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  23.73 
 
 		 678 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  24.48 
 
 		 726 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.15 
 
 		 669 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  27.15 
 
 		 684 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  23.73 
 
 		 676 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.81 
 
 		 669 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.81 
 
 		 669 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>