121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4625 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  100 
 
 		 569 aa  1170    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  41.34 
 
 		 802 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  38.04 
 
 		 1088 aa  347  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  26.47 
 
 		 580 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.34 
 
 		 757 aa  107  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.79 
 
 		 1041 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.45 
 
 		 1107 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.14 
 
 		 508 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  27.38 
 
 		 482 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  25.88 
 
 		 713 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.48 
 
 		 1263 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  28.65 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  26.91 
 
 		 1749 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  22.91 
 
 		 1024 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.02 
 
 		 886 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  27.38 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.78 
 
 		 1015 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  29.19 
 
 		 892 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  26.88 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.19 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.18 
 
 		 867 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.06 
 
 		 863 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.58 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  23.21 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  26.6 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  27.74 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  27.13 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  25.11 
 
 		 648 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.53 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  31.36 
 
 		 1344 aa  63.9  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  27.63 
 
 		 149 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  23.12 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  30.32 
 
 		 204 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  27.13 
 
 		 447 aa  62  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  25.41 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.43 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  26.6 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32.37 
 
 		 761 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.77 
 
 		 937 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  35 
 
 		 291 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.19 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  26.34 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  26.6 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  26.67 
 
 		 937 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  24.41 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  26.06 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  26.06 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  23.2 
 
 		 601 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5172  hypothetical protein  30 
 
 		 826 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  32.5 
 
 		 225 aa  57  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  33.9 
 
 		 791 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 451 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  39.47 
 
 		 675 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  27.03 
 
 		 242 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  25.97 
 
 		 925 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  29.9 
 
 		 558 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 471 aa  53.9  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  34.78 
 
 		 1112 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1744 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  25.79 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0685  hypothetical protein  27.68 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  35.62 
 
 		 108 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  30.67 
 
 		 447 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  27.04 
 
 		 528 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 444 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  27.47 
 
 		 249 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  28.92 
 
 		 2132 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1269  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 		 360 aa  50.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.407419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  28.83 
 
 		 440 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 460 aa  50.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 469 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 439 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  32.05 
 
 		 744 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  27.11 
 
 		 1017 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4404  hypothetical protein  32.22 
 
 		 428 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.56 
 
 		 531 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  31.06 
 
 		 1088 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 		 440 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  28.41 
 
 		 565 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  33.98 
 
 		 293 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  30.25 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 		 444 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  26.76 
 
 		 972 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  26.32 
 
 		 473 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  23.86 
 
 		 2491 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  27.42 
 
 		 396 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  35.82 
 
 		 2324 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 		 437 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1227  hypothetical protein  51.02 
 
 		 270 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>