110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0103 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 711 aa  1443    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  26.19 
 
 		 664 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  28.2 
 
 		 922 aa  101  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  27.82 
 
 		 922 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  34.36 
 
 		 617 aa  95.1  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  21.44 
 
 		 812 aa  92  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  29.91 
 
 		 883 aa  92.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  22.92 
 
 		 821 aa  85.5  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  27.27 
 
 		 830 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.7 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  30.94 
 
 		 787 aa  68.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  29.94 
 
 		 840 aa  67  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1185 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  27.54 
 
 		 974 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  27.97 
 
 		 974 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  41.12 
 
 		 1160 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  27.97 
 
 		 974 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  32.98 
 
 		 712 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  26.84 
 
 		 973 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  26.72 
 
 		 974 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  26.29 
 
 		 974 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  27.54 
 
 		 974 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  27.54 
 
 		 974 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  27.69 
 
 		 877 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  49.15 
 
 		 729 aa  63.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  40.91 
 
 		 1163 aa  62.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1149 aa  61.6  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  23.77 
 
 		 874 aa  61.2  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1284 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  40 
 
 		 1210 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1153 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  35 
 
 		 978 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  35 
 
 		 978 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  33.63 
 
 		 1167 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1144 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1156 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1156 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  27.45 
 
 		 1171 aa  58.9  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  56.52 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1156 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1156 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1156 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1156 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  31.3 
 
 		 818 aa  58.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  30.25 
 
 		 917 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1156 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1167 aa  57.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1065 aa  57.4  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1157 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  33.03 
 
 		 979 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  27.57 
 
 		 199 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  40 
 
 		 767 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  27.57 
 
 		 199 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  40 
 
 		 767 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  30.24 
 
 		 1047 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1280 aa  56.2  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1467 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1282 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1047 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1194 aa  55.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1351 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1181 aa  54.3  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  40.28 
 
 		 1348 aa  53.9  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  29.82 
 
 		 901 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  40 
 
 		 1155 aa  53.9  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1186 aa  53.9  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  34.78 
 
 		 885 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  37.33 
 
 		 918 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  33.7 
 
 		 883 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  27.16 
 
 		 812 aa  52.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1277 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  32.11 
 
 		 968 aa  52  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  31.76 
 
 		 817 aa  51.6  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3265  DNA repair ATPase-like protein  29.92 
 
 		 757 aa  51.2  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1153 aa  50.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  23.79 
 
 		 618 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  30 
 
 		 1179 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  24.37 
 
 		 789 aa  50.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  31.18 
 
 		 873 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  34 
 
 		 1180 aa  50.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  27.33 
 
 		 892 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  31.53 
 
 		 946 aa  49.3  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  42.86 
 
 		 758 aa  48.9  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  42.86 
 
 		 758 aa  48.9  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 880 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  29.88 
 
 		 984 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  35.8 
 
 		 878 aa  48.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  38 
 
 		 1201 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  24.03 
 
 		 1057 aa  48.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  27 
 
 		 878 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  30.97 
 
 		 890 aa  48.1  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  30.43 
 
 		 877 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  30.43 
 
 		 877 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  30.43 
 
 		 877 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1153 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1157 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  30.43 
 
 		 877 aa  47.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1152 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>