More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0297 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  69.57 
 
 		 965 aa  1307    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 922 aa  1866    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1789  hypothetical protein  38.22 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0254074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1954  ATPase  37.8 
 
 		 673 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342143  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2442  ATPase  33.75 
 
 		 756 aa  238  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0026  hypothetical protein  31.42 
 
 		 692 aa  209  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  33.25 
 
 		 932 aa  164  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 793 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1120  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 		 523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1875  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 813 aa  112  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.42 
 
 		 810 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 833 aa  102  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 		 681 aa  98.2  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 909 aa  98.2  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  36.93 
 
 		 739 aa  97.8  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.16 
 
 		 816 aa  96.3  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  36.25 
 
 		 603 aa  95.1  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 		 637 aa  94  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 		 583 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 362 aa  93.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  38.51 
 
 		 560 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  36.78 
 
 		 865 aa  92  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  40.12 
 
 		 685 aa  91.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 		 878 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  40.74 
 
 		 623 aa  90.1  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  35.53 
 
 		 795 aa  89  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 632 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.27 
 
 		 714 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 927 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  33.15 
 
 		 732 aa  81.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 612 aa  80.1  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 750 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  36.23 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 1276 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 824 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 646 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 3172 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  39.61 
 
 		 649 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  39.61 
 
 		 649 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 602 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.47 
 
 		 626 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1867  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 714 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1094 aa  74.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 1694 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  38.1 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 3301 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 804 aa  72.8  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 847 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  38.52 
 
 		 437 aa  72  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 754 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 589 aa  72  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 3035 aa  72  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 543 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  36.6 
 
 		 750 aa  70.9  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.71 
 
 		 397 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  26.53 
 
 		 1014 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 754 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  35.03 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 265 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4868  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 363 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  34.1 
 
 		 780 aa  69.7  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  36.98 
 
 		 725 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 711 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  34.59 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.5 
 
 		 626 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.5 
 
 		 626 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  38.1 
 
 		 435 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 833 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 614 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.5 
 
 		 614 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 614 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 435 aa  67  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 614 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.5 
 
 		 614 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.93 
 
 		 887 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  36.76 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 620 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 265 aa  66.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  36.03 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  36.07 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 828 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.49 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.59 
 
 		 622 aa  64.7  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  39.22 
 
 		 1131 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  38.41 
 
 		 252 aa  63.9  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 275 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  34.87 
 
 		 1180 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>